Zmarł 8 (21) czerwca 1908 roku w Lubieńsku, w swojej podmiejskiej posiadłości, gdzie aktualnie znajduje się memorialny kompleks muzealny kompozytora, łączący dwie zrekonstruowane posiadłości – dom w Lubieńsku i sąsiednie mienie Wieczasza, gdzie kompozytor żył do 1907 roku. Został pochowany w Petersburgu na Cmentarzu Nowodziewiczym. W latach 30. XX wieku prochy zostały przeniesione na Cmentarz Tichwiński w Petersburgu.
Działalność pedagogiczna Rimski-Korsakow był twórcą szkoły kompozytorskiej, wśród jego uczniów było około dwustu kompozytorów, dyrygentów, muzykoznawców, między innymi Fiodor Akimienko, Nikołaj Amani, Nikołaj Arcybuszew, Anton Arienski, Meliton Balancziwadze, Siemion Barmotin, Felix Blumenfeld, Nikołaj Czeriepnin, Aleksandr Głazunow, Michaił Gniesin, Aleksandr Grieczaninow, Michaił Ippolitow-Iwanow, Andriej Kazbiriuk, Anatolij Ladow, Mykoła Łysenko, Nikołaj Malko, Nikołaj Miaskowski, Aleksandr Ossowski, Siergiej Prokofjew, Ottorino Respighi, Nikołaj Sokołow, Aleksandr Spendiarian, Igor Strawinski, Maksimilian Sztajnberg, Aleksandr Taniejew, Jāzeps Vītols, Julia Wejsberg, Wasilij Zołotariow.
Studenci z Polski Konstanty Gorski Emil Młynarski Witold Maliszewski