Ze względu na ówczesną sytuację polityczną i bliski związek klubu i jego zawodników z socjaldemokracją klub został rozwiązany.
Po zakończeniu II wojny światowej wielu starych członków klubu zebrało się i reaktywowało SC E-Werk Wien. Jednak dopiero w 1946 udało się skompletować zespół, aby startować w Wiener 2. Klasse (D4). W 1948 r. Postanowiono zmienić nazwę sekcji piłkarskiej KSV Wiener Elektrizitätswerke na FS Elektra Wien. Po zdobyciu tytułu mistrzowskiego w Wiener 2. Klasse B w 1949 roku awansował do Wiener Stadtligi (D2). Po wygraniu rok później drugiej ligi zdobył historyczny awans do Staatsliga A. Debiutowy sezon 1950/51 na najwyższym poziomie zakończył na ostatniej 13.pozycji i został zdegradowany do Staatsliga B. W następnym sezonie po zajęciu 12.pozycji spadł do Wiener Stadtligi (D3). W 1957 wrócił do Staatsliga B, która w 1959 zmieniła nazwę na Regionalliga Ost. Po 12 latach gry w drugiej lidze w 1969 spadł na rok do Wiener Stadtligi. W następnym sezonie 1970/71 uplasował się na 12.miejscu w Regionalliga Ost i spadł ponownie do Wiener Stadtligi. W 1974 po reorganizacji systemu lig status Wiener Stadtligi został obniżony do IV poziomu. Po wygraniu Wiener Stadtligi w 1975 awansował do Regionalliga Ost, ale w 1978 znów spadł do Wiener Stadtligi. W 1995 spadł do Wiener Oberliga B (D5).