Jest proktorem (proctor) szkoleń echo guidance firmy Abbott w zabiegach strukturalnych, takich jak przezcewnikowa naprawa zastawki mitralnej i trójdzielnej (MitraClip/TriClip).
Działalność naukowo-dydaktyczna i kliniczna Pracuje jako adiunktka w I Katedrze i Klinikce Kardiologii Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego. Prowadzi szkolenia z echokardiografii klinicznej dla lekarzy w ramach kształcenia podyplomowego. Jest współtwórczynią Akademii Echokardiografii – platformy internetowej oferującej kursy, webinary i warsztaty z echokardiografii i kardiologii. Prowadzi również działalność edukacyjną skierowaną do pacjentów z chorobami układu sercowo-naczyniowego.
Główne obszary badawcze Moniki Budnik obejmują kardiomiopatię takotsubo (zespół takotsubo, TTS) – jej diagnostykę, przebieg kliniczny i rokowanie odległe – a także echokardiografię kliniczną z uwzględnieniem obrazowania trójwymiarowego (3D).