Istotnym elementem działalności Centralnego Zarządu było również zapewnienie prawidłowego funkcjonowania bazy produkcyjnej przemysłu tłuszczowego, w tym właściwego wykorzystania zakładów, urządzeń, surowców i środków finansowych. Centralizacja zarządzania miała umożliwić koncentrację środków produkcyjnych, racjonalizację ich wykorzystania oraz dostosowanie wielkości i struktury produkcji do potrzeb wynikających z planu gospodarczego.
Szczególne znaczenie miało także powiązanie działalności przemysłu tłuszczowego z bazą surowcową rolnictwa, w tym zwłaszcza zaopatrzenia, zbytu oraz kontraktacji roślin oleistych, co wskazuje na szerszy zakres oddziaływania tego ogniwa zarządzania na funkcjonowanie całego łańcucha produkcyjnego przemysłu tłuszczowegoArchiwum Akt Nowych, Centralny Zarząd Przemysłu Tłuszczowego w Warszawie, sygn. 1–40, 45, 1949–1958..
Tak określona rola Centralnego Zarządu odpowiadała zasadom organizacji gospodarki zarówno centralnie planowej, jak i państwowej, w których wykonanie planu gospodarczego stanowiło podstawowe kryterium działalności przedsiębiorstw państwowych.