Arcybiskup limski 11 września 1907 prezydent Peru mianował go arcybiskupem limskim oraz prymasem Peru, co zatwierdził 16 grudnia 1907 papież Pius X. 14 stycznia 1908 przyjął sakrę biskupią z rąk delegata apostolskiego w Peru abpa Angelo Marii Dolciego. Współkonsekratorami byli emerytowany biskup Arequipy Manuel Segundo Ballón Manrique oraz biskup Puno Ismaele Puirredóna.
Szczególną troską otoczył seminarium, duszpasterstwo parafialne i klasztory. Zakupił nowoczesny sprzęt dla gazety katolickiej. W 1912 przeprowadził synod prowincjonalny. Przez cały pontyfikat nie odbył żadnej wizytacji w podległych mu parafiach, ani wizyty ad limina.
W 1915 rząd José Pardo y Barredy zreformował Konstytucję Peru, proklamując wolność wyznania i modyfikując uprzywilejowany status, jakim cieszył się Kościół katolicki. Reforma wywołała falę ataków na Kościół, skierowanych przede wszystkim na Uniwersytet Świętego Marka – jedyny uniwersytet w kraju. Skłoniło to peruwiański episkopat do założenia Katolickiego Uniwersytetu Peru w Limie.
Arcybiskupem limskim był do śmierci 10 września 1917.