Życie prywatne Franz Beckenbauer był trzykrotnie żonaty. Pierwsze małżeństwo trwało od 1966 do 1990 roku. Pierwszą żoną była Brigitte Wittmann (ur. 1944, zm. 2021 z powodu złamania kości udowej), para wychowywała trzech synów: Stephana i Michaela oraz Thomasa, syna Franza z poprzedniego związku z Ingrid Grönke. W latach 1977–1988 był związany z fotografką Dianą Sandmann. W 1990 roku wziął drugi ślub z Sybille Weimer sekretarką DFB – niemieckiego związku piłki nożnej, z którą się rozwiódł w 2004 roku. W dniu 23 czerwca 2006 roku ożenił się po raz trzeci z Heidi Brumester. Para miała dwoje dzieci Joela Maximiliana i córkę Francescę. Beckenbauer mieszkał od 1982 roku w austriackim Oberndorfie w Tyrolu. Beckenbauer był także zapalonym golfistą rodzaju Handicap.
Zmarł 7 stycznia 2024 w Salzburgu. Został pochowany 12 stycznia 2024 w grobie swoich rodziców na cmentarzu w Perlacher Forst, w Monachiumhttps://sportowy24.pl/beckenbauer-w-swojej-ostatniej-drodze-pozegnany-jedynie-przez-najblizszych-cichy-pogrzeb-kaisera-na-cmentarzu-w-monachium/ar/c2-18231967..
Statystyki Klubowe