Dalsze lata Po wojnie działał w Naczelnej Radzie Odbudowy Warszawy, od listopada 1946 r. do 1951 r. był prezesem Społecznego Komitetu Odbudowy Warszawy. W latach 1946–1950 pełnił funkcję wiceprezesa Izby Przemysłowo- -Handlowej w Warszawie.
Zmarł 23 czerwca 1957 i został pochowany na cmentarzu Powązkowskim w Warszawie (kwatera 74-5-15).
W 2022 roku Fundacja ,,Stare Powązki" z inicjatywy Premiera RP Mateusza Morawieckiego ze środków z KPRM odnowiła grób ministra Klarnera.
Życie prywatne Syn Emiliana i Konstancji z Osmólskich. Od 14 września 1907 był żonaty z Florentyną z Jaworowskich, z którą miał pięcioro dzieci.
Okresy sprawowania urzędu ministra
Minister Przemysłu i Handlu
16 V - 13 XI 1925 p.o. 13-20 XI 1925
Minister Skarbu
8 VI - 24 IX 1926 p.o. 24-27 IX 1926 27-30 IX 1926 p.o. 30 IX - 2 X 1926
thumb|Grób Czesława Klarnera na cmentarzu Powązkowskim w Warszawie (2023) Prace Czesław Klarner, Polityka mieszkaniowa w Polsce i za granicą (1930), Czesław Klarner, U podstaw bezrobocia (1935), Czesław Klarner, Dochód społeczny wsi i miast w Polsce w okresie przesilenia gospodarczego 1929–1936 (1937), Czesław Klarner, Zarys stosunków społeczno-gospodarczych w Polsce (1949).