W 2006 przegrał z Menziesem Campbellem, a w 2007 z Nickiem Cleggiem.
W wyborach krajowych w 2005 z ramienia liberałów uzyskał mandat deputowanego do Izby Gmin w okręgu wyborczym Eastleigh, w związku z czym odszedł z PE. W 2010 z powodzeniem ubiegał się o reelekcję. W koalicyjnym rządzie Davida Camerona został sekretarzem stanu (ministrem) ds. energii i zmian klimatycznych.
Postępowanie karne 3 lutego 2012 został zmuszony do ustąpienia ze stanowiska rządowego w związku z przedstawieniem mu zarzutów kryminalnych dotyczących świadomego wprowadzenia w błąd wymiaru sprawiedliwości. Według policji, gdy w 2003 należący do Chrisa Huhne'a samochód został zarejestrowany przez fotoradar na jeździe z nadmierną prędkością, polityk i jego ówczesna żona wbrew prawdzie oświadczyli, iż to kobieta była kierowcą, dzięki czemu Chris Huhne uniknął otrzymania mandatu i zarazem przekroczenia limitu punktów karnych. 5 lutego 2013 zrezygnował z mandatu parlamentarnego, zaś 11 marca 2013 zarówno on, jak i jego była małżonka, zostali skazani na osiem miesięcy pozbawienia wolności.