Autor licznych artykułów naukowych. Publikował m.in. w Physical Review B, Solid State Physics, Theoria et Historia Scientiarum, Zagadnieniach Filozoficznych w Nauce, Zagadnieniach Naukoznawstwa oraz Kwartalniku Historii Nauki i Techniki.
Był uczestnikiem wielu konferencji naukowych, m.in. światowych kongresów historii nauki i logiki, metodologii oraz filozofii nauki oraz międzynarodowych konferencji Europejskiego Towarzystwa Historii Nauki. Organizował też krajowe i międzynarodowe konferencje naukowe. W szczególności był inicjatorem i organizatorem 2nd International Conference of the European Society for the History of Science (Kraków, 6–9.09.2006) i konferencji naukowej "Tajemnice grobu Mikołaja Kopernika. Dialog ekspertów" (Kraków, 22–23.02.2010), podczas której dyskutowano na temat poważnych wątpliwości dotyczących rzekomego ostatecznego odkrycia szczątków Mikołaja Kopernika; jest autorem wielu artykułów wykazujących brak merytorycznych podstaw do uznania tego grobu za grób Kopernika.
W 2010 roku został laureatem Nagrody Naukowej im.