Jakub i Maria mieli razem dwóch synów i córkę: Jakub (22 maja 1540 – kwiecień 1541), książę Rothesay Artur (kwiecień 1541), książę Rothesay Maria (8 grudnia 1542 – 8 lutego 1587), królowa Szkocji
Jakub miał również wiele nieślubnych dzieci:
Z Elizabeth Shaw: James Stewart (1529–1558), opat Kelso i Melrose
Z lady Małgorzatą Erskine, córką Johna Erskine, 4. hrabiego Mar: James Stewart (1531 – 23 stycznia 1570), 1. hrabia Moray
Z Euphemią Elphistone, córką Alexandra, lord Elphinstone: Robert Stewart (1533–1591), hrabia Orkadów
Z Elizabeth Katherine Carmichael, córką sir Johna Carmichaela: John Stewart (przed 1531–1563), ożenił się z Joanną Hepburn i miał z nią syna Franciszka, hrabiego Bothwell
Z Elżbietą Stewart: Adam Stewart (zm. 1606), ożenił się z Janet Ruthven i miał z nią córkę Marię.
Z Elizabeth Bethune: Joanna, żona Archibalda Campbella, 5. hrabiego Argyll. Nie mieli razem dzieci.
Kategoria:Stuartowie Kategoria:Książęta Rothesay Kategoria:Władcy Szkocji Kategoria:Odznaczeni Orderem Podwiązki Kategoria:Odznaczeni Orderem Złotego Runa Kategoria:Urodzeni w 1512 Kategoria:Zmarli w 1542