zastępczym trybem uruchomienia było GNOME 2.32 na sprzęcie, na którym Unity nie może działaćCanonical Says Unity 2D Not Part Of The Ubuntu 11.04 PlanComment 8 for bug 730588.
W marcu 2011 pojawiły się spory między Canonical i twórcami GNOME. W ramach rozwoju Unity, włączono kod API jako zewnętrzną zależność GNOME. Według Davida Neary, zewnętrzną zależnością jest moduł niezależny od GNOME, który jest zależnością pakietu w zawartego w zestawie modułów GNOME oraz powody, dlaczego libappindicator nie została przyjęta jako zewnętrzną zależność, bo „nie pasuje do tej definicji”, ponieważ „powiela funkcjonalność libnotify” (obecnie GNOME Shell) oraz jej CLA nie spełnia obecnej polityki GNOME.
W kwietniu 2011 Mark Shuttleworth ogłosił, że Ubuntu 11.10 nie będzie zawierało klasycznego pulpitu GNOME w przeciwieństwie do Ubuntu 11.04 jako interfejsu zastępczego dla Unity. W Ubuntu 11.10 interfejsem zastępczym, dla użytkowników, którzy nie mają technicznych możliwości do uruchomienia Unity, będzie Unity 2D. Jednakże GNOME będzie dostępne w repozytoriach jako interfejs zastępczy w Ubuntu 11.10.