Trójcy, 1936. Encyklopedia Staropolska, 1936, 1939 (współpraca z Aleksandrem Brücknerem przy doborze ilustracji). Cultural Losses of Poland, 1944. Nie od razu Kraków zbudowano, 1944, 1947, 1956. Grobowiec Jagiełły, 1949. Bibliografia polska XIX stulecia, 1959–1976. Krystianna, 1957. Łańcuch Aleksandry, 1966 Leon Chwistek, 1968. Collegium Maius – dzieje gmachu, 1968. Szkice o Bereccim, 1970. Collegium Maius – dzieje, obyczaje, zbiory, 1970. Trzy rozmowy pułkownika Odysa, 1975. Nieznana księga Tacyta, 1976. Zamęt, 1976. Historia sztuki w zarysie, 1973. Straty kultury polskiej pod okupacją niemiecką 1939–1944 wraz z oryginalnymi dokumentami grabieży (Cultural Losses of Poland during the German occupation 1939–1944 with original documents of the looting), przedmowa: Zbigniew Witek, Kraków 2003 (wersja elektroniczna)
Bibliografie prac Estreichera Bibliografia prac prof. Karola Estreichera jr. (1906–1984) za lata 1927–2006 (nr 1–317), zestawił Dariusz Matelski, [w:] Zbigniew Witek, Karol Estreicher (1906–1984), tom III: Życie po życiu, Kraków 2007, s. 293–307. Bibliografia prac dr. Karola Estreichera jr.