W World Series 1971, w którym Pirates pokonali Baltimore Orioles w siedmiu meczach, mając między innymi średnią uderzeń 0,414, slugging percentage 0,759, zdobywając dwa home runy i zaliczając 4 RBI został wybrany najbardziej wartościowym zawodnikiem finałów.
Clemente działał także charytatywnie. Po trzesięniu ziemi w Nikaragui, które miało miejsce 23 grudnia 1972, zaangażował się w pomoc humanitarną dla ofiar z Managui. Dowiedziawszy się, że wysłany transport z żywnością nie dotarł do miejsca docelowego, zdecydował się osobiście polecieć do tego kraju. 31 grudnia 1972 tuż po starcie z lotniska w San Juan samolot runął do morza. Ciała Clemente i pozostałych członków załogi nigdy nie odnaleziono. W 1973 został członkiem Galerii Sław Baseballu, ponadto 14 maja 1973 w uznaniu wybitnego wkładu sportowego, obywatelskiego, charytatywnego i humanitarnego, został uhonorowany pośmiertnie Złotym Medalem Kongresu (Congressional Gold Medal) – jednym z najwyższych odznaczeń cywilnych w Stanach Zjednoczonych.