20 grudnia 1704 roku został mianowany na profesora filozofii i matematyki w Athenaeum Illustre w Amsterdamie. 24 stycznia 1705 roku otrzymał tytuł magistra lub wówczas oznaczający to samo tytuł doktora filozofii na uniwersytecie w Harderwijk. 26 sierpnia 1717 roku otrzymał powołanie na profesora języka greckiego na uniwersytecie we Franeker. Jednakże Hemsterhuis pozostał jeszcze 3 lata w Amsterdamie, zanim 6 marca 1720 roku podjął pracę wygłaszając mowę wstępną de Graecae Linguae praestantia ex ingenio Graecorum et moribus probata (Franeker 1720). Był rektorem tej uczelni w latach 1723/24, 1729/30, jak również 1738/39. Podczas składania urzędu rektora wygłosił następujące mowy Brevi quasi tabella proponam quo quis ingenio natus, quibus a natura animi dotibus instructus, colendis in humanioribus literis philologiaeque studio ornando plurimum et sibi et aliis sit profuturus (1724), de Paulo Apostolo (1730) und de Mathematum et Philosophiae studio cum Literis humanioribus coniungendis (1739).