Jednak przez problemy finansowe klub został rozwiązany w 1993 roku.
Nowy klub o nazwie AS Taranto 1906 powstał 13 sierpnia 1993 roku i startował w Serie D. Zespół awansował do Serie C2 w 1995, ale w 1997 roku spadł do Campionato Nazionale Dilettanti. W 1998 klub przyjął nazwę US Arsenaltaranto, a w 1999 awansował do Serie D. W 2000 awansował do Serie C2 i zmienił nazwę na Taranto Calcio Srl. Jednakże 16 grudnia 2004 roku klub po raz kolejny ogłosił upadłość i w konsekwencji upadłości powierzył klub na ręce biznesmena Vito Luigi Blasi, który zmienił jego nazwę na Taranto Sport Srl. W roku 2006 zespół awansował do Serie C1, która w 2008 została przekształcona w Lega Pro Prima Divisione.
29 czerwca 2012 roku klub ogłosił o rezygnacji z rozgrywek w zawodowym futbolu włoskim, a 20 lipca 2012 został reorganizowany w klub o nazwie Taranto FC 1927 i startował w amatorskiej Serie D. W 2015 klub przekształcił nazwę na SSD Taranto FC 1927. W 2016 awansował do Serie C, zmieniając nazwę na Taranto Football Club 1927 S.r.l.