difficile oceniano w zakresie ok. 77–100% (w zależności od sposobu wprowadzenia preparatu).
Mechanizm działania Mechanizm działania przeszczepu mikrobioty jelitowej nie jest w pełni wyjaśniony, ponieważ przenoszony materiał stanowi złożoną mieszaninę mikroorganizmów oraz ich produktów, a skutki zależą m.in. od cech dawcy, biorcy, drogi podania i schematu okołozabiegowego.
W nawrotowym zakażeniu C. difficile za kluczowe uznaje się odtworzenie tzw. oporności kolonizacyjnej mikrobioty po zaburzeniu spowodowanym m.in. antybiotykoterapią, co może ograniczać dalszą ekspansję C. difficile i ryzyko nawrotów.
Skuteczność w zakażeniach C. difficile FMT może przynosić szybkie ustąpienie objawów i ograniczać ryzyko kolejnych nawrotów u pacjentów z nawrotowym zakażeniem C. difficile. W randomizowanym badaniu klinicznym u większości pacjentów w grupie FMT uzyskano wyleczenie po pierwszym zabiegu, a odsetek wyleczeń wzrósł po powtórnym podaniu preparatu u części chorych. Zestawienia danych w polskich rekomendacjach wskazują na wysoką skuteczność FMT w metaanalizach dotyczących nawrotowego zakażenia C. difficile.