coli czy niektórych wirusów), co odzwierciedla zmienność praktyk między ośrodkami i badaniami.
W niektórych krajach funkcjonują „banki kału”, gdzie są przechowywane pobrane i przygotowane wcześniej preparaty mikrobioty jelitowej.
Przygotowanie i podanie preparatu Przygotowanie Wskazano, że materiał do transferu powinien pochodzić ze świeżego wypróżnienia (do 6 godzin od defekacji) albo z puli mrożonej przechowywanej w temperaturze ok. −80 °C (bezpośrednio po rozmrożeniu), a jednorazowa procedura obejmuje użycie co najmniej 50 g kału. W przeglądzie w języku polskim opisywano protokoły, w których próbkę stolca pozyskuje się maksymalnie do 24 godzin przed zabiegiem (często preferencyjnie 2–6 godzin) oraz zaleca się wykorzystanie stolca stałego, niebiegunkowego.
Etap przygotowania preparatu obejmuje rozcieńczenie materiału i uzyskanie zawiesiny możliwej do podania do przewodu pokarmowego. W rekomendacjach (PTEiLChZ) podano przykład rozcieńczenia kału w 0,9% NaCl w objętości ok. 100 ml przy planowanym podaniu przez sondę żołądkową oraz ok. 300 ml przy planowanym podaniu do jelita grubego.