Ze względu na ich interwencje, popadł w niełaskę u cesarza, a w 1674 roku został aresztowany, posądzony o zdradę i osadzony w Raudnitzy, gdzie zmarł 3 lata później.
Działania na rzecz Księstwa Lobkowitz jako kolejny właściciel pałacu w Żaganiu podjął się w 1670 ukończenia jego budowy. To dzięki niemu i jego synowi oraz następcy Ferdniandowi Augustowi von Lobkovitzowi udało się dokończyć i ukształtować niemal ostateczny wygląd pałacu, który nazwany jest na ich cześć pałacem Lobkowitzów. Prace powierzono Antoniemu della Porcie, który stworzył projekt tak, aby pałac przypominał rodową siedzibę Lobkowitzów w Roudnicy. W rezultacie do roku 1693 powstało manierystyczno-barokowe założenie pałacowe istniejące do dziś.
Życie prywatne Václav Eusebius ożenił się po raz pierwszy 3 października 1638 z Johaną Myškovą ze Žlunic (1600–1650). Nie mieli dzieci.
Po raz drugi ożenił się 6 stycznia 1653 z Augustą Zofią von Pfalz-Sulzbach (1624–1682), córką księcia Augustusa von Sulzbacha. Mieli pięcioro dzieci, lecz pierwszy syn urodził się martwy (1654).