Równocześnie powstał Wojewódzki Sztab Wojskowy w Elblągu (WSzW) – początkowo z siedzibą w Kwidzynie, a od grudnia 1975 r. w Elblągu przy ul. Saperów 34. W nowym układzie administracyjnym województwa, WSzW w Elblągu miało w swym składzie trzy WKU: w Braniewie, Elblągu i Malborku. Z dniem 15 marca 1994 r. WKU w Elblągu zmieniła siedzibę przy ul. Saperów 34 na budynek przy ul. Królewieckiej 167A, w którym stacjonuje do chwili obecnej.
Od 1 lipca 1996 r. do 30 listopada 1998 r. Wojskowa Komenda Uzupełnień w Elblągu podlegała Wojewódzkiemu Sztabowi Wojskowemu w Elblągu, który bezpośrednio podlegał Dowództwu Warszawskiego Okręgu Wojskowego. Z dniem 1 lutego 1998 r. WSzW w Elblągu zostało podporządkowane Dowództwu Pomorskiego Okręgu Wojskowego. W związku z reformą administracyjną kraju i utworzeniem województwa Warmińsko – Mazurskiego, z dniem 30 czerwca 1999 r. zostało zlikwidowane WSzW w Elblągu. Od 1 lipca 1999 r. do 31 sierpnia 2002 r. Wojskowa Komenda Uzupełnień w Elblągu, jako terenowy organ administracji wojskowej, bezpośrednio podlegała Wojewódzkiemu Sztabowi Wojskowemu w Olsztynie i swym zasięgiem obejmowała powiat elbląski i miasto Elbląg. Zgodnie z rozporządzeniem Ministra Obrony Narodowej z dnia 16 maja 2002 r.