Śmierć Schindler, znajdujący się w krytycznym stanie, przestał oddychać. W chwili przywiezienia do szpitala miał zmiażdżoną głowę, 8 złamanych żeber, obrażenia klatki piersiowej i brzucha, liczne siniaki na szyi, mocno zdeformowaną twarz, uniemożliwiającą identyfikację, złamany nos i górną szczękę, poszarpane prącie. Sekcja zwłok wykazała, że prawie każdy wewnętrzny narząd w organizmie był zniszczony w dużym stopniu. Identyfikacji ciała dokonała matka i siostra Schindlera. Najbliższa rodzina była w stanie zidentyfikować go wyłącznie przez tatuaż znajdujący się na jego ramieniu.
Komunikat US Navy i opinia patologa sądowego Po morderstwie Schindlera, US Navy wydała komunikat, w którym zaprzeczyła, jakoby kiedykolwiek otrzymała skargi o molestowaniu radiooperatora, odmówiła publicznego wypowiadania się w sprawie i po informacje o zabójstwie kierowała do japońskiej policji.
Patolog sądowy porównał obrażenia Schindlera do tych, które ponoszą ofiary stratowane przez konie. Uszkodzenia ciała były podobne do tych, które występują u osób zmarłych w wyniku wypadku samochodowego z wysoką prędkością jazdy lub wypadku samolotu z niską prędkością.