Na ostatnim miejscu w finale znalazł się reprezentant gospodarzy Marcelo Chierighini (48,41).
Terminarz Wszystkie godziny podane są w czasie brazylijskim (UTC-03:00) oraz polskim (CEST). Data Godzina rozpoczęciaUTC-03:00CEST9 sierpnia 2016 13:02 18:02 Eliminacje 22:03 3:03 Półfinały10 sierpnia 2016 23:03 4:03 Finał
Rekordy Przed zawodami rekord świata i rekord olimpijski wyglądały następująco: RekordZawodnikCzasMiejsceDataRekord świata César Cielo 46,91 Rzym 30 lipca 2009Rekord olimpijski Eamon Sullivan 47,05 Pekin 13 sierpnia 2008
Wyniki Eliminacje
Miejsce Wyścig Tor Zawodnik Państwo Czas Uwagi 1. 7 3 Kyle Chalmers 47,90 Q, WJ 2. 7 2 Caeleb Dressel 47,91 Q 3. 5 6 Duncan Scott 48,01 Q, 4. 8 4 Cameron McEvoy 48,12 Q 5. 6 5 Santo Condorelli 48,22 Q 6. 6 8 Joseph Schooling 48,27 Q, 7. 8 8 Damian Wierling 48,35 Q 8. 6 3 Władimir Morozow 48,39 Q 9. 8 2 Pieter Timmers 48,46 Q 10. 8 5 Luca Dotto 48,47 Q 11. 7 8 Yuri Kisil 48,49 Q 12. 6 2 Sebastiaan Verschuren 48,51 Q 13. 6 6 Marcelo Chierighini 48,53 Q14. 6 4 Ning Zetao 48,57 Q 8 3 Clément Mignon 48,57 Q 16. 7 4 Nathan Adrian 48,58 Q 17. 6 1 Katsumi Nakamura 48,61 18. 7 5 Jérémy Stravius 48,62 19. 5 5 Glenn Surgeloose 48,65 20. 5 1 Kristian Gołomeew 48,68 21. 7 6 Andriej Grieczin 48,75 22. 8 6 Federico Grabich 48,78 23. 4 2 Dylan Carter 48,80 24.