Kradzieże w muzeum Wypchane ptaki 24 czerwca 2009 roku miała w muzeum miejsce kradzież 299 jaskrawo upierzonych, wypchanych ptaków, głównie samców trogonów i kwezali z Ameryki Środkowej i Południowej, a także rajskich ptaków z Nowej Gwinei. Policja ogłosiła 12 listopada 2010 roku, że 22-letni obywatel USA został zatrzymany w okolicach Tring w związku z kradzieżą, a większość ptaków odzyskano. Edwin Rist, student Królewskiej Akademii Muzycznej, przyznał się do kradzieży w dniu 24 listopada 2010. W kwietniu 2011 Rist został skazany na 12 miesięcy więzienia w zawieszeniu na dwa lata oraz nakaz nadzoru. Był również zobowiązany do zwrotu 125 150 £ – szacowanych wpływów ze sprzedaży skór ptaków za pośrednictwem takich platform jak eBay. Policja poinformowała również, że odzyskano do tej pory 191 nienaruszonych skór ptaków, z których tylko 101 miały etykiety z zapisem danych naukowych.
Rogi nosorożców Rankiem 27 sierpnia 2011 roku złodziej włamał się przez frontowe drzwi muzeum i skradł rogi z dwóch wystaw eksponatów nosorożców, jeden nosorożca indyjskiego, a drugi białego, używając do ich oderwania dużego młota.