Ożenił się 13 maja 1835 roku z Elizabeth Frances, córką Roberta Aglionby’ego Slaneya (wieloletniego posła okręgu Shrewsbury z ramienia wigów), po którym współdziedziczyła majątek. Małżonkowie mieli siedmioro dzieci. Córka, Charlotte Eyton, została autorką naukowych prac przyrodniczych. Zmarł w Eyton 25 października 1880 roku.
Publikacje W 1835 założono w Shropshire stowarzyszenie miłośników historii naturalnej (Shropshire and North Wales Natural History and Antiquarian Society), z jego muzeum, a w następnym roku została wydana bogato ilustrowana książka Eytona pt. History of the Rarer British Birds, która budzi duże zainteresowanie do czasów współczesnych (była wielokrotnie wznawiana). Ilustracje do pracy Eytona wykonał Marks, miejscowy rytownik (zob. drzeworyt, litografia, chromolitografia). Uważa się, że wykonane przez niego ilustracje oddają wygląd ptaków nie mniej wiernie niż ilustracje ze znanej książki Thomasa Bewicka, opublikowanej ponad 30 lat wcześniej („A History of British Birds”, 1803).