Po zaręczynach Amelii i Owena, para wspólnie planuje ślub. Amelia ma jednak obawy, związane z jej przeszłością, które pojawiają się nawet w dniu ślubu. Powoduje to, że Amelia myśli o ucieczce sprzed ołtarza. Ostatecznie, w finale dwunastego sezonu Amelia i Owen biorą ślub i zamieszkują razem w jego domu. Niedługo potem Amelia dowiaduje się, że może być w ciąży. To powoduje, że pojawiają się obawy związane z poprzednią ciążą. Małżonkom coraz trudniej się dogadać, dlatego Amelia wyprowadza się. W pracy przez długi czas unika męża. W finale trzynastego sezonu, kiedy Owen dowiaduje się, że jego uznana za zmarłą siostra, Megan żyje, Amelia wspiera go. Sama odkrywa, że ma guza mózgu. Sprowadza więc do szpitala swojego znajomego neurochirurga, dr Thomasa Koracicka i poddaje się operacji. Po pewnym czasie oboje z Owenem decydują się na rozstanie.