23 czerwca 1939 był sygnatariuszem układu Turcji z Francją w sprawie przyłączenia prowincji Hatay do Turcji. Wojska tureckie objęły prowincję 23 lipca 1939. Po pakcie Ribbentrop-Mołotow i wybuchu II wojny światowej 19 października 1939 zawarł sojusz obronny z Wielką Brytanią i Francją. Upadek Francji w czerwcu 1940 spowodował zwrot Turcji w kierunku polityki neutralności, którą realizował Saracoğlu. 18 czerwca 1941, krótko przed planowanym atakiem Niemiec na ZSRR, podpisał w Ankarze układ o nieagresji z III Rzeszą.
Po nagłej śmierci Refika Saydama 9 lipca 1942 został powołany na urząd premiera Turcji, który sprawował do 7 sierpnia 1946. Rząd Saracoğlu przeprowadził w Turcji dwie ważne reformy: podatek majątkowy (Varlik Vergisi), nałożony na przedsiębiorców i handlowców, i reformę rolną, która dokonała podziału między bezrolnych chłopów gruntów należących do państwa i wielkiej własności ziemskiej.