W 1642 r. Szymon Szczotka z żoną Anną ufundowali do świątyni wielki dzwon ...gdzie tam jeszcze żadnego dzwonu nie było, tylko sygnans na kościele. W 1644 r. parafię włączono do nowo powstałego dekanatu żywieckiego. W 1663 r. zawieszono na wieży drugi dzwon, a w następnym roku niejaki Adam Mikołajczyk z Ciśca w podzięce za uratowanie z wód wezbranej Skawy ufundował do kościoła ołtarz św. Anny. 26 lipca 1697 r. uroczyście wprowadzono do kościoła Bractwo Świętej Anny, a kilku mieszkańców Żywiecczyzny ufundowało kosztowne sukienki i korony do obrazu św. Anny.
Budowa obecnego, murowanego kościoła została rozpoczęta w 1834 roku i ukończona w 1839 roku. Świątynia została wzniesiona w stylu tzw. nadwiślańskim. W dniu 25 lipca 1847 roku kościół został uroczyście poświęcony. Budowę nowej świątyni prowadzili dwaj proboszczowie: ksiądz Wojciech Krokowski i ksiądz Marcin Pająk. Budowa była wspomagana przez wójtów: Szymona Jurasza z Żabnicy, Jana Dziedzica z Ciśca, Jana Zawadę z Kamesznicy, Marcina Boraka z Szarego, Jana Witosa z Nieledwi oraz wójtów Kazimierza Tyca i Jana Zarzeckiego z Milówki. Świątynia została konsekrowana w dniu 17 lipca 1860 roku.