En la temporada 2008-2009, el FC Barcelona Atlètic va jugar al grup III de la Segona Divisió B del futbol espanyol. Tot i comptar amb jugadors de gran qualitat que acabarien fent el salt al primer equip, com Busquets, Thiago, Nolito o Fontàs, el filial blaugrana va terminar la lliga en 5a posició, a un punt de les places de playoff a Segona Divisió A.
Plantilla 2008-2009 La plantilla del Barça Atlètic durant la temporada 2008-2009 va ser la següent:
Cos tècnic Primer entrenador: Luis Enrique Segon entrenador: Joan Barbarà Mata Preparador físic: José Ramón Callén Delegat: Antoni Alonso Velázquez Fisioterapeutes: Roger Giornes Tomas i Jaume Langa Ferrer
Categoria:Futbol Club Barcelona B