Això és una llista de les espècies enregistrades de mamífers salvatges natius de Madagascar. D'acord amb les dades de juny de 2014 (seguint la revaloració dels lèmurs de la UICN) hi ha 241 espècie extants de mamífers reconegudes a Madagascar, de les quals 22 estan en perill crític d'extinció, 62 estan en perill, 32 són vulnerables, 9 estan gairebé amenaçades, 72 es troben en risc mínim i per a les 44 espècies restants manquen dades d'avaluació o no han estat avaluades encara. Totes les espècies en perill crític són lèmurs. Es creu que la majoria, si no la totalitat, de les 29 espècies extintes van desaparèixer en temps prehistòrics, després del primer contacte amb els éssers humans fa aproximadament 2000 anys; es creu que cap d'aquestes va sobreviure fins al període de contacte europeu.
La fauna mamífera de Madagascar és altament distintiva i en gran part endèmica. El tàxon no marí, no quiròpter està constituït (a data de juny de 2014) de 168 espècies, 40 gèneres i 9 famílies; d'aquestes, totes són formes endèmiques, excepte, potser, una espècie, tots excepte un gènere, i totes excepte tres famílies.
Les següents etiquetes es fan servir per indicar l'estat de conservació de cada espècie segons l'avaluació de la UICN: EX Extinta No hi ha cap dubte raonable que el seu darrer individu ha mort. EWExtinta en estat salvatge Només se'n coneix la supervivència en cultius, en captivitat o com a població o poblacions naturalitzades molt allunyades de la seva àrea de distribució anterior. CR En perill crític L'espècie corre un risc extremadament gran d'extingir-se en estat salvatge. EN En perill L'espècie corre un risc molt gran d'extingir-se en estat salvatge. VU Vulnerable L'espècie corre un gran risc d'esdevenir una espècie "en perill" en estat salvatge. NT Gairebé amenaçada L'espècie està propera a ser qualificada com a vulnerable. LC Risc Mínim L'espècie no és actualment en risc d'extinció en estat salvatge. DD Dades insuficients No hi ha informació adequada per avaluar el risc d'extinció per aquesta espècie. NE No avaluada L'estat de conservació de l'espècie no ha estat estudiat.
Subclasse: Teris Infraclasse: Euteris Superordre: Afroteris Ordre: Afrosorícids (tenrecs i talps daurats) miniatura|Tenrec espinós petit miniatura|Tenrec ratllat de plana miniatura|Tenrec espinós gros miniatura|Tenrec comú L'ordre afroteri dels afrosorícids conté els talps daurats d'Àfrica del sud i el tenrecs de Madagascar i Àfrica. Es creu que tots els tenrecs natius de Madagascar descendeixen d'un avantpassat comú que va arribar a l'illa fa 25–42 milions d'anys des d'Àfrica (on només 3 subfamílies de tenrecs, els potamogalins, hi sobreviuen). Família: Tenrecs (Tenrecidae) Subfamília: Geogalinae Gènere: Geogale Tenrec orellut Geogale aurita LC Subfamília: Orizorictins (Oryzorictinae) Gènere: Limnogale Tenrec aquàtic Limnogale mergulus VU Gènere: Tenrec musaranya (Microgale) Tenrec musaranya cuacurt Microgale brevicaudata LC Tenrec musaranya de Cowan Microgale cowani LC Tenrec musaranya de Dobson Microgale dobsoni LC Tenrec musaranya de Drouhard Microgale drouhardi LC Tenrec musaranya arborícola Microgale dryas VU Tenrec musaranya pàl·lid Microgale fotsifotsy LC Tenrec musaranya gràcil Microgale gracilis LC Microgale grandidieri Tenrec musaranya de nas nu Microgale gymnorhyncha LC Tenrec musaranya de Jenkins Microgale jenkinsae EN Microgale jobihely EN Tenrec musaranya cuallarg Microgale longicaudata LC Microgale macpheei EX (PH) Microgale majori LC Tenrec musaranya de muntanya Microgale monticola VU Tenrec musaranya de Nasolo Microgale nasoloi VU Tenrec musaranya pigmeu Microgale parvula LC Tenrec musaranya cuallarg meridional Microgale principula LC Tenrec musaranya petit Microgale pusilla LC Tenrec musaranya de dents de musaranya Microgale soricoides LC Tenrec musaranya de Taiva Microgale taiva LC Tenrec musaranya de Talazac Microgale talazaci LC Tenrec musaranya de Thomas Microgale thomasi LC Gènere: Tenrec d'arrossar (Oryzorictes) Tenrec d'arrossar central Oryzorictes hova LC Tenrec d'arrossar tetradàctil Oryzorictes teradactylus DD Subfamília: Tenrec (Tenrecinae) Gènere: Tenrec espinós petit (Echinops) Tenrec espinós petit Echinops telfairi LC Gènere: Tenrec ratllat (Hemicentetes) Tenrec ratllat muntanyenc Hemicentetes nigriceps LC Tenrec ratllat de plana Hemicentetes semispinosus LC Gènere: Tenrec espinós gros (Setifer) Tenrec espinós gros Setifer setosus LC Gènere: Tenrec comú (Tenrec) Tenrec comú Tenrec ecaudatus LC
Ordre: †Bibymalagasia Bibymalagasia és un ordre enigmàtic representat per dues espècies extintes de mamífers d'una mida aproximada a la dels gossos, probablement insectívors que vivien a Madagascar. Tot i que les seves relacions han estat debatudes, s'ha pensat que podien pertànyer al superordre dels afroteris. Les anàlisis morfològiques han tendit a col·locar-los propers als porcs formiqguers (ordre Tubulidentata), potser a causa d'especialitzacions convergents per cavar. L'anàlisi de seqüències de col·lagen conservades, tanmateix, els col·loca dins l'ordre Afrosoricida, més proper als tenrecs. Les dues espècies difereixen en la seva mida i aspectes morfològics. Van sobreviure fins fa uns 2150 anys. Gènere: †Plesiorycteropus Plesiorycteropus germainepetterae EX (Prehistòric, PH) Plesiorycteropus madagascariensis EX (PH)
Ordre: Sirenia (manatís i dugongs) miniatura|Dugong Els sirenis són un ordre de mamífers aquàtics, són herbívors que habiten als rius, estuaris, aigües marines costaneres, aiguamolls, i zones humides marines. Actualment, les quatre espècies vivents estan llistades com a vulnerables per la UICN. El dugong habita àmpliament al llarg de les costes d'Àfrica de l'est fins a Australàsia. Aquestes espècies i el tenrecs són els únics afroteris extants de Madagascar. Família: Dugòngid (Dugongidae) Gènere: Dugong (Dugong) Dugong Dugong dugon VU
Superordre: Euarcontoglirs Ordre: Primats miniatura|†Archaeolemur edwardsi miniatura|Lèmur nan de cua gruixuda miniatura|Lèmur ratolí gris miniatura|Lèmur ratolí pigmeu miniatura|Ai-ai miniatura|Indri miniatura|Sifaca de Coquerel miniatura|Sifaca de diadema miniatura|Sifaca de Perrier miniatura|Lèmur coronat miniatura|Lèmur negre miniatura|Lèmur de panxa vermella miniatura|Lèmur bru de front vermell miniatura|Lèmur gris del llac Alaotra
L'ordre dels primats conté totes les espècies generalment relacionades amb els lèmurs, els micos, i els simis, incloent-hi els éssers humans. És dividit en quatre grups principals: estrepsirrins, tarsers, micos del Món Nou i catarrins. A Madagascar s'hi troben 15 gèneres extants de primats no humans, en comparació amb els 6 d'Amèrica Central, 20 d'Amèrica del Sud, 23 d'Àfrica i 19 d'Àsia. Els primats endèmics de Madagascar són els lèmurs, la branca més gran dels estrepsirrins. Entre els anys 2000 i 2008, 39 espècies noves van ser descrites, incrementant el nombre total d'espècies i subespècies reconegudes fins a 99; l'any 2014, el nombre d'espècies i subespècies extants reconegudes havia augmentat fins a 105. D'aquestes, la UICN va classificar-ne 24 en perill crític, 49 en perill, 20 en estat vulnerable, tres gairebé amenaçades, tres amb risc mínim, quatre sense dades suficients i dues romanen encara a ser avaluades. Es creu que l'avantpassat comú dels lèmurs va arribar a Madagascar creuant el Canal de Moçambic des de l'Àfrica fa entre 50 i 60 milions d'anys. Es creu que un nombre d'espècies de lèmur més grans que qualsevol de les actualment vives, variant en la seva mida fins a arribar a la d'un goril·la, es van extingir poc després de l'arribada dels éssers humans. Els estrepsirrins conformen la totalitat d'espècies de primats natius de Madagascar, però només un quart de les d'Àfrica, sent la resta simis. Els estrepsirrins de Madagascar ocupen ambdós nínxols biològics diürns i nocturns, mentre que tots aquells fora de Madagascar són nocturns i gairebé tots els simis són diürns (l'única excepció són les mones de nit, que viuen en llocs on els estrepsirrins hi són absents).Cawthon Lang KA. 2005 juliol 18. Subordre: Strepsirrhini Infraordre: Lèmurs Família: †lèmur mico (†Archaeolemuridae) Gènere: †Archaeolemur Archaeolemur edwardsi EX (PH) Archaeolemur majori EX (PH) Gènere: †Hadropithecus Hadropithecus stenognathus EX (PH) Família: Quirogalèids (Cheirogaleidae) Gènere: Allocebus Lèmur nan d'orelles peludes Allocebus trichotis VU Gènere: Cheirogaleus Cheirogaleus andysabini NE Lèmur nan de Crossley Cheirogaleus crossleyi DD Cheirogaleus lavasoensis NE Lèmur nan gros Cheirogaleus major DD Lèmur nan de cua gruixuda Cheirogaleus medius LC Lèmur nan gris petit Cheirogaleus minusculus DD Lèmur nan de Sibree Cheirogaleus sibreei CR Gènere: Lèmurs ratolí (Microcebus) Lèmur ratolí d'Arnhold Microcebus arnholdi EN Lèmur ratolí de Berthe Microcebus berthae EN Lèmur ratolí de Bongolava Microcebus bongolavensis EN Microcebus boraha NE Lèmur ratolí de Danfoss Microcebus danfossi EN Microcebus ganzhorni NE Microcebus gerpi CR Lèmur ratolí gris rogenc Microcebus griseorufus LC Lèmur ratolí de Jolly Microcebus jollyae EN Lèmur ratolí de Goodman Microcebus lehilahytsara VU Lèmur ratolí de MacArthur Microcebus macarthurii EN Microcebus manitatra NE Microcebus marohita CR Lèmur ratolí de Claire Microcebus mamiratra CR Lèmur ratolí de Margot Marsh Microcebus margotmarshae EN Lèmur ratolí de Mittermeier Microcebus mittermeieri EN Lèmur ratolí gris Microcebus murinus LC Lèmur ratolí pigmeu Microcebus myoxinus VU Lèmur ratolí de Ravelobe Microcebus ravelobensis EN Lèmur ratolí bru Microcebus rufus VU Lèmur ratolí del Sambirano Microcebus sambiranensis EN Lèmur ratolí de Simmons Microcebus simmonsi EN Lèmur ratolí d'Anosy Microcebus tanosi NE Lèmur ratolí rogenc Microcebus tavaratra VU Gènere: Mirza Lèmur nan de Coquerel Mirza coquereli EN Lèmur nan septentrional Mirza zaza EN Gènere: Lèmurs forcats (Phaner) Lèmur forcat de la Montagne d'Ambre Phaner electromontis EN Lèmur forcat de Masoala Phaner furcifer VU Lèmur forcat pàl·lid Phaner pallescens EN Lèmur forcat de Pariente Phaner parienti EN Família: Daubentoniidae Gènere: Daubentonia Ai-ai Daubentonia madagascariensis EN Ai-ai gegant Daubentonia robusta EX (PH) Família: Índrid (Indriidae) Gènere: Indri llanós (Avahi) Indri llanós betsileo Avahi betsileo EN Indri llanós de Bemaraha Avahi cleesei EN Indri llanós de oriental Avahi laniger VU Indri llanós meridional Avahi meridionalis EN Indri llanós dels Moore Avahi mooreorum EN Indri llanós occidental Avahi occidentalis EN Indri llanós de Peyriéras Avahi peyrierasi VU Indri llanós de Ramanantsoavana Avahi ramanantsoavani VU Indri llanós del Sambirano Avahi unicolor 'EN Gènere: Indri IndriIndri Indri CR Gènere: Sifaques (Propithecus) Sifaca sedós Propithecus candidus CR Sifaca de Coquerel Propithecus coquereli EN Sifaca coronat Propithecus coronatus EN Sifaca de Van der Decken Propithecus deckenii EN Sifaca de diadema Propithecus diadema CR Sifaca de Milne-Edwards Propithecus edwardsi EN Sifaca de Perrier Propithecus perrieri CR Sifaca de Tattersall Propithecus tattersalli CR Sifaca de Verreaux Propithecus verreauxi EN Família: Lemúrids (Lemuridae) Gènere: Eulemur Lèmur bru, Eulemur fulvus NT Lèmur bru de Sanford, Eulemur sanfordi EN Lèmur de front blanc, Eulemur albifrons EN Lèmur bru de front vermell, Eulemur rufus VU Lèmur de front vermell, Eulemur rufifrons NT Lèmur bru de collar, Eulemur collaris EN Lèmur de cap gris, Eulemur cinereiceps CR Lèmur negre, Eulemur macaco VU Lèmur negre ullblau, Eulemur flavifrons CR Lèmur coronat, Eulemur coronatus EN Lèmur de panxa vermella, Eulemur rubriventer VU Lèmur mangosta, Eulemur mongoz CR Gènere: Lèmurs del bambú (Hapalemur) Lèmur gris oriental, Hapalemur griseus VU Hapalemur griseus gilberti EN Hapalemur griseus griseus VU Hapalemur griseus ranomafanensis DD