Els excavats (Excavata) són un gran clade dintre dels eucariotes. El clade conté una gran varietat de formes de vida lliure i simbiòtiques, i inclou alguns paràsits importants per als humans. Un grup, les euglenofícies, conté nombroses espècies amb cloroplasts i és estudiat pels botànics.
Característiques Diversos excavats estan mancats dels clàssics mitocondris i sovint se'ls anomena "amitocondriats", tot i que la majoria retenen un orgànul mitocondrial enormement modificat. D'altres tenen mitocondris amb crestes tubulars, discoidals o en alguns casos planes. La majoria d'excavats tenen dos, quatre o més flagels i molts tenen una ultraestructura característica mantinguda per microtúbuls que els serveix per a l'alimentació. Tanmateix, hi ha diversos grups mancats d'aquests trets que són considerats excavats degut a l'evidència genètica.
Classificació Els excavats es classifiquen en quatre grups que poden ser tractats com a fílums: Metamònads p.ex. Giardia, Trichomonas Amitocondriats, la majoria simbionts amb animals Loukozous p.ex. Jakoba Percolozous p.ex. Naegleria, Acrasis La majoria amb formes entre flagel·lades i ameboides Euglenozous p.ex. Euglena, Trypanosoma Diversos paràsits importants, amb un gran grup amb cloroplasts
D'aquests, els percolozous i euglenozous semblen ser parents particularment relacionats i estan units per la presència de crestes mitocondrials discoides. La majoria de loukozous tenen crestes tubulars, com molts altres eucariotes, mentre que els metamònads són inusuals per haver perdut els clàssics mitocondris, tot i que ells tenen "hidrogenosomes", "mitosomes" o orgànuls no caracteritzats. Les relacions dels excavats encara romanen incertes; és possible que no siguin un grup monofilètic.
Sovint es consideren certs excavats entre els eucariotes més primitius, basant-se particularment en la seva posició en diversos arbres evolutius. Això podria esperonar les investigacions que proposessin que són un clade parafilètic amb altres eucariotes. Tanmateix, la posició de certs excavats en "branques basals" podria ser un artefacte causat per l'atracció entre branques llargues, com s'ha vist en alguns altres grups, com per exemple els microsporidis.
Subgrups Els excavats es classifiquen dins sis subdivisions principals a nivell de fílum/classe. Es mostren a la taula de sota. Un organisme addicional, Malawimonas, també es pot incloure dins els excavats, malgrat que l'evidència filogenètica és equívoca. Superfílum Fílum/Classe Gèneres representatius Descripció Discoba o JEHEuglenozoa e.g. Euglena, Trypanosoma Paràsits molt importants que tenen cloroplastsHeterolobosea (Percolozoa) e.g. Naegleria, Acrasis La majoria alternen formes flagel·lades i ameboidesJakobea e.g. Jakoba, Reclinomonas De vida lliureMetamonada o PODPreaxostyla e.g. Oxymonads, Trimastix Trimastix és de vida lliureFornicata e.g. Giardia, Carpediemonas Paràsits d'animals.Parabasalia e.g. Trichomonas En insectes, alguns són patògens en humans.
Discoba o clade JEH Euglenozoa i Heterolobosea (Percolozoa) semblen estar estretament relacionats i estan units per la presència de cristalls discoides dins els mitocondris (superfílum Discicristata). Més recentment s'ha trobat una relació estreta entre Discicristata i Jakobida.
Cladograma El següent arbre filogenètic mostra les relacions entre els diferents grups d'excavats:Brown, M. W., Heiss, A. A., Kamikawa, R., Inagaki, Y., Yabuki, A., Tice, A. K., ... & Roger, A. J. (2018). Phylogenomics places orphan protistan lineages in a novel eukaryotic super-group. Genome biology and evolution, 10(2), 427-433.Romain Derelle et al 2015, Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root. Proceedings of the National Academy of Sciences 112(7) · January 2015 with 248 Reads DOI: 10.1073/pnas.1420657112
Referències