thumb|upright=1.24|Mapa de Somalilandia francesa, Yibuti moderno. El bloqueo británico impidió las comunicaciones marítimas directas entre Yibuti, la capital y Obock La Somalia francesa durante la Segunda Guerra Mundial, oficialmente la «Costa Francesa de los Somalíes» o Côte française des Somalis, con su capital en Yibuti, fue escenario de escaramuzas menores durante dicha guerra, principalmente entre junio y julio de 1940. Después de la caída de Francia, el 25 de junio de 1940, la colonia estuvo brevemente en el limbo hasta que un gobernador leal al gobierno de Vichy fue instalado el 25 de julio. Fue la última posesión francesa en África que permaneció leal a Vichy, rindiéndose a las fuerzas francesas libres el 26 de diciembre de 1942. Pierre Nouailhetas gobernó el territorio durante la mayor parte del período de Vichy. Después de los bombardeos aéreos de los británicos, instituyó un reino de terror contra los europeos y los locales. Nouailhetas fue finalmente retirado o forzado a retirarse. A partir de septiembre de 1940, la colonia estuvo bajo un bloqueo aliado y muchos de sus habitantes huyeron a la vecina Somalia británica. Después de la liberación del territorio, hubo muchos gobernantes y la recuperación de la privación de 1940-42 solamente comenzó cuando la guerra terminó en 1945. Antecedentes thumb|upright|Desembarco de tropas francesas en Yibuti en 1935 thumb|upright|Convoy de suministro italiano en Yibuti, c. 1936–38 En 1934-35, las tensiones italo-etíope afectaron al Cuerno de África, mientras que en Europa el rearme alemán pesaba sobre el gobierno francés. Buscando el apoyo italiano contra Alemania en caso de guerra, Francia cedió varios territorios, incluido un pequeño trozo de territorio en el norte de Somalilandia a la Eritrea italiana, en el Acuerdo Mussolini-Laval del 7 de enero de 1935. Este tratado nunca fue ratificado por Italia y aunque se hicieron preparativos para transferir el territorio, en realidad no fue transferido antes del estallido de la guerra en 1940.
En 1935, Italia invadió Etiopía y el gobierno francés prestó mayor atención a la defensa de la Somalia francesa. En enero de 1938, una fuerza italiana se trasladó a la llanura de HanléHanlé is a wadi (French oued) in the south of the Danakil Desert, in northern Djibouti en territorio francés y acampó allí. Italia afirmó que este territorio se encontraba en el lado etíope de la frontera, según el tratado franco-etíope de 1897. El ministro colonial francés Georges Mandel y el comandante en jefe de Yibuti, Paul Legentilhomme, respondieron reforzando las defensas de la colonia a niveles sin precedentes: 15 000 soldados estaban estacionados allí y se establecieron puestos en Afambo, Moussa Ali e incluso al otro lado de los italianos.Mockler pone el número en 5000. Las fortificaciones de tierra se ampliaron considerablemente con hormigón.
En octubre de 1938, a raíz del Acuerdo de Munich, Italia exigió concesiones a Francia, entre ellas un puerto franco en Yibuti y el control del ferrocarril Yibuti-Addis Abeba. El 30 de noviembre, tras las protestas antifrancesas en Roma, el ministro de Asuntos Exteriores italiano, Galeazzo Ciano, exigió la cesión de la Somalia francesa a Italia. Hablando en la Cámara de Diputados sobre las «aspiraciones naturales del pueblo italiano», lanzó gritos de '¡Niza! ¡Corcega! ¡Saboya! ¡Túnez! ¡Yibuti! ¡Malta!
El 18 de diciembre de 1938, hubo una contra-manifestación en Yibuti en la que una gran multitud se reunió en el centro de la ciudad ondeando la bandera francesa y gritando consignas pro-francesas. Mientras tanto, los italianos construyeron una serie de pequeños puestos en Abba, Dagguirou, Gouma, etc., dentro de la frontera occidental de la Somalia francesa, afirmando a finales de 1939 que el territorio siempre había sido parte de Etiopía. En abril de 1940, afirmaron que los franceses habían construido un puesto en Afambo en territorio indiscutiblemente italiano, aunque no hay registros de que hubiera habido un puesto allí antes de que los italianos construyeran uno en octubre de 1940. thumb|upright|El aumento del ejército francés en 1938-39 thumb|upright|Legentilhomme revisando tropas, c. 1939
En enero de 1940, el virrey y comandante en jefe italiano en África Oriental, el príncipe Amadeo II de Saboya-Aosta, presentó a Roma una propuesta de invasión "sorpresa" de la Somalia francesa, en la que participaron dieciséis batallones motorizados y una fuerza de 6000 miembros de la tribu Azebo Galla y 6000 miembros de la tribu Danakil que ya se encontraban en las cercanías de la frontera. En poco tiempo se filtró el plan y, en respuesta, el general Guglielmo Nasi fue sustituido como gobernador de Harar por un civil, Enrico Cerulli. La horda Danakil continuó vigilando la frontera.
En vísperas de la guerra mundial, Fauque de Jonquières, comandante de batallón, estaba a cargo de la unidad de inteligencia local, que a su vez formaba parte de la Section d'Études Militaires (SEM), la estación de la Oficina Decimosegunda de Marsella. Después de la conquista italiana de Etiopía, dio dinero, armas, asesores, propaganda y refugio a la resistencia etíope. Un oficial de la reserva francesa, P. R. Monnier, fue asesinado en una misión secreta en Etiopía en noviembre de 1939. A pesar de que la Somalia británica limitaba con el territorio francés y ambos estaban rodeados por el África oriental italiana, no se llevó a cabo ningún plan militar conjunto anglo-francés antes de una reunión en Adén en junio de 1939. Del 8 al 13 de enero de 1940 se celebró una segunda conferencia en Yibuti. El comandante en jefe británico en Oriente Medio, el general Archibald Wavell, también acordó que el comandante en jefe francés en Yibuti, Paul Legentilhomme, comandaría las fuerzas militares en ambas Somalilands en caso de guerra con Italia.
Guerra con Italia y armisticio Luchas del 10 al 25 de junio La declaración de guerra de Italia contra Francia y Gran Bretaña llegó el 10 de junio de 1940 y al día siguiente, el 11 de junio, Legentilhomme fue nombrado comandante supremo de todas las fuerzas aliadas en el llamado «teatro de Somalilandia», donde tenía una guarnición de siete batallones de infantería senegalesa y somalí, tres baterías de cañones de campaña, cuatro baterías de cañones antiaéreos, una compañía de tanques ligeros, cuatro compañías de milicias e irregulares, dos pelotones del cuerpo de dromedarios y un surtido de aviones.
Dado que los Aliados estaban superados en número por unos 40 000 a 9 000 a lo largo de la frontera de Somalilandia,Mockler sitúa la guarnición de la Somalilandia francesa en unos 1 000 hombres. Dice que Legentilhomme planeaba invadir Etiopía a lo largo del ferrocarril. no se planificaron acciones ofensivas, aunque Legentilhomme recibió una orden el 11 de junio para resistir "hasta el final" —jusqu'au bout—. La intención era inmovilizar a los italianos mientras avivaban una revuelta etíope. thumb|300px|left|La línea verde marca el límite de la ocupación italiana en la Somalia francesa Los italianos emprendieron algunas acciones ofensivas a partir del 18 de junio. Desde la gobernación de Harrar, las tropas del general Guglielmo Nasi atacaron el fuerte de Ali-Sabieh en el sur y Dadda'a en el norte. También hubo combates en la zona de Dagguirou y alrededor de los lagos Abbe y Ally.. En pocos días las tropas coloniales italianas ocuparon casi 1/4 del territorio de la Somalia francesa. Cerca de Ali-Sabieh, hubo algunas escaramuzas sobre el ferrocarril Yibuti-Addis Abeba.
En la primera semana de guerra, la Armada italiana envió a los submarinos Torricelli y Perla a patrullar las aguas territoriales francesas en el Golfo de Tadjoura frente a los puertos de Yibuti, Tadjoura y Obock.Para más información, ver Flotilla del Mar Rojo A finales de junio los italianos también habían ocupado las fortificaciones fronterizas de Magdoul, Daimoli, Balambolta, Birt Eyla, Asmailo, Tewo, Abba, Alailou, Madda y Rahale.
El 17 de junio, algunos aviones italianos Meridionali Ro.37 bis realizaron un reconocimiento de Yibuti, observando cinco o seis buques de guerra en el puerto y una veintena de aviones en un aeródromo cercano. Ese mismo día, los franceses evacuaron la estación periférica de Dadda'to y Douméra en la frontera aunque no está claro si había sido atacada por Italia. Los franceses lo reconquistaron enseguida. El 21 de junio, once Caproni Ca.133 bombardearon Yibuti en la mayor incursión de la breve guerra de la colonia. El fuego antiaéreo fue intenso y dos aviones italianos no regresaron, pero se vieron incendios y explosiones en Yibuti. El 22 de junio, los italianos sospecharon que los británicos podrían intentar establecer una base de avanzada en Yibuti, y cinco aviones Ro.37bis, cuatro CR.42 y un CR.32 con base en Dire Dawa ametrallaron el aeródromo.Mockler informó que cuatro se estrellaron
Un piloto italiano describió este ataque en su diario: La defensa antiaérea es muy pobre ... Hicimos otro giro para ver si alguno de los combatientes franceses tendría el coraje de despegar. ¡Ninguno!.El diario de este piloto fue capturado y traducido por los británicos. Su identidad es desconocida. Algunos aviones de reconocimiento franceses Potez 25 TOE bombardearon instalaciones italianas en Dewele en represalia.A su regreso a Dire Dawa, el periodista italiano señaló que al mediodía 'tres aviones franceses nos atacan por sorpresa, uno de nuestros aviones es destruido en tierra'.
Armisticio de Villa Incisa El llamamiento del general Charles de Gaulle del 18 de junio para que los oficiales y soldados franceses ignoraran el inminente armisticio franco-italiano fue a su vez ignorado por la mayoría de los oficiales en Somalia, solo el propio Legentilhomme estaba a favor de ponerse del lado de De Gaulle y de Francia libre. El 25 de junio entró en vigor el Armisticio de Villa Incisa, poniendo fin a la guerra entre Italia y Francia. Pidió la desmilitarización de Somalia «mientras duren las hostilidades entre Italia y el Imperio Británico», y concedió a Italia «el derecho pleno y constante de utilizar el puerto de Yibuti con todo su equipamiento, junto con la sección francesa del ferrocarril, para todo tipo de transporte» (artículo 3). El lugar de entrega de «todas las armas y municiones muebles, así como las que se entregarán a las tropas que efectúen la evacuación del territorio en un plazo de 15 días» (artículo 5), los procedimientos de desmovilización y desarme de las fuerzas francesas (artículo 9) y las condiciones de comunicación inalámbrica entre Francia y las colonias (artículo 19) se dejaron en manos de una Comisión Italiana de Control del Armisticio mientras que Legentilhomme se demoró en el cumplimiento de las condiciones de armisticio, ya que había perdido el contacto con el Gobierno de Francia. El 28 de junio, cuando los italianos le exigieron que cumpliera ciertas cláusulas, negó todo conocimiento de las mismas.
Luchas después del armisticio thumb|Fuerte francés en Ali-Sabieh, con vistas al ferrocarril, hacia 1940