thumb|280px|Mapa de Kirguistán.
Kirguistán es un país sin acceso al mar ubicado en Asia central. La región montañosa de Tian Shan cubre el 80% del país. Se encuentra entre las latitudes 39° y 44° N, y las longitudes 69° y 81° E. Está más lejos del mar que cualquier otro país del mundo, y todos sus ríos desembocan en sistemas de drenaje cerrados que no llegan al mar. La región montañosa del Tian Shan cubre más del 80% del país, de ahí que Kirguistán se conozca ocasionalmente como "la Suiza de Asia Central".
El lago Issyk-Kul, o Ysyk-Köl en kirguís, en el noreste de Tian Shan, es el lago más grande de Kirguistán y el segundo lago de montaña más grande del mundo después del Titicaca. Los picos más altos están en el rango de Kakshaal-Too, formando la frontera china. El pico Jengish Chokusu, a 7439 m, es el punto más alto y los geólogos lo consideran el pico más septentrional de más de 7000 m en el mundo. Las fuertes nevadas en el invierno provocan inundaciones en la primavera que a menudo causan graves daños en el río. El deshielo de las montañas también se utiliza para la hidroelectricidad.
Kirguistán tiene importantes depósitos de metales, como el oro y los metales de tierras raras. Debido al terreno predominantemente montañoso del país, menos del 8% de la tierra se cultiva, y esto se concentra en las tierras bajas del norte y las franjas del valle de Ferganá.
Biskek en el norte es la capital y la ciudad más grande, con 937 400 habitantes (datos de 2015). La segunda ciudad es la antigua ciudad de Osh, ubicada en el valle de Ferganá, cerca de la frontera con Uzbekistán. miniaturadeimagen|Playa de Kirguistán en el Lago Issyk-Kul que cubre un área de 6.236 km² (una superficie más grande que la de Brunéi o Trinidad y Tobago) El río principal es el Kara Daria, que fluye hacia el oeste a través del valle de Fergana hacia Uzbekistán. Al otro lado de la frontera en Uzbekistán se encuentra con otro importante río kirguiso, el Narýn. La confluencia forma el Sir Daria, que originalmente fluyó hacia el mar de Aral. A partir de 2010, ya no llega al mar, ya que su agua se extrae aguas arriba para irrigar los campos de algodón en Tayikistán, Uzbekistán y el sur de Kazajistán. El río Chu también fluye brevemente a través de Kirguistán antes de entrar a Kazajistán.
Relieve thumb|280px|Montañas de Tian Shan donde aparece el monte Khan Tengri (6995 m) en el centro y los montes Tomur y Podeba, en la frontera entre China y Kirguistán. thumb|280px|Topografía de Kirguistán. Cordilleras. El país está rodeado por diversas cordilleras montañosas, las montañas de Fergana al noroeste, la cordillera del Pamir con las montañas Alai, al sudoeste, y varias ramas del Tien Shan en el centro y el este que alcanzan con facilidad los 5.000 m de altura, siendo el pico Jengish Chokusu, también conocido como Victory Peak o pico Victoria en la frontera con China, el más alto con 7.439 ; otras alturas importantes son el pico Lenin, al sur cerca de la frontera con Tayikistán, con 7.134 , y el pico Khan Tengri, con 6.995 m, en la unión entre Kirguistán, Kazajistán y la Región Autónoma Uigur de Sinkiang en China. El centro está formado por tres depresiones que drena el río Naryn de este a oeste. Las depresiones están rellenas por depósitos morrénicos en su mayoría.
Los sistemas montañosos de Tian Shan, las montañas celestiales, y la cordillera del Pamir, al sur, cubren el 65 por ciento del territorio nacional. Las montañas Alai, que pertenecen al Pamir, ocupan el sudoeste del país, junto con las sierras de Kok Shaal-Tau, Trans-Alay (Zaalay) y Atbashi, mientras que la parte principal de la cordillera de Tian Shan se extiende hacia el este hasta la frontera entre el sur de Kirguistán y China, antes de seguir por la Región Autónoma Uigur de Sinkiang, en China. La altura media de Kirguistán es de 2.750 m, con alturas que oscilan entre los 394 m del valle de Fergana, cerca de Osh y los 7.439 m del pico Jengish Chokusu. Casi el 90 por ciento, de la población vive a más de 1.500 m de altura.
Al oeste hay una gran depresión, el valle de Fergana. Al este, en el extremo nororiental, dos brazos del Tian Shan, las cordilleras de Kungey-Alatau y Terskey-Alatau (el Alatau kirguís) encierran el lago Issyk-Kul. El valle de Fergana está separado de las altas mesetas alpinas centrales y orientales por las montañas de Fergana, que van de sudeste a noroeste, y la cordillera de Chatkal, que culmina a 4.503 m.
Las montañas de Tian Shan están formadas por rocas cristalinas y sedimentarias del Paleozoico, con los valles rellenos de sedimentos jóvenes. Al norte y al este predomina el granito. En el norte y el este, la roca sedimentaria producida durante el Paleozoico ha sido casi totalmente erosionada, pero en el sur y el oeste predominan las rocas sedimentarias metamórficas con algunas intrusiones volcánicas. Hace 25 millones de años se iniciaron una serie de movimientos de la corteza que han formado acumulaciones de rocas en los valles y formaron lagos que se han secado y convertido en depósitos de sales.
Las sierras de Kirguistán thumb|280px|Alatau Kirguís, cerca de la frontera con Kazajistán, donde se prolonga en el Talas Alatau. Hay 88 sierras principales en Kirguistán, la mayor parte de las cuales pertenecen al Tien Shan. Solo la sierra de Alai, al sur, pertenece al Pamir. La carretera de Osh, al sudoeste a Biskek, al norte, divide al país en dos mitades. La mayor parte de las sierras tienen de 100 a 300 km. Las más largas son las de Kakshaal, con 582 km, y el Alatau Kirguís, al sur de Biskek, con 454 km. La mayoría tiene entre 10 y 40 km de anchura.
Los picos son relativamente fáciles de conquistar. En tiempos de la Unión Soviética, los montañeros que ascendían los cinco picos de más de 7.000 m recibían un premio llamado Leopardo de las Nieves, conseguido por unos 600 escaladores.
La vertiente norte de las montañas suele ser más fría y estar arbolada, mientras la vertiente sur es más cálida y se usa para pastos.
El Tien Shan tiene unos 2800 km de longitud y unos 800 km de anchura, con 40 picos que superan los 6.000 m de altitud. La mayor parte se encuentra en Kirguistán, desde la sierra de Chaktal, al este de Taskent, en Uzbekistán, hasta Urumchi, en Sinkiang, China. Tien Shan suele dividirse en Norte, Este, Oeste, Central e Interior. La parte central al sudeste del lago Issyk-Kul, posee los picos más altos, el Khan Tengri y el Pobeda, con más de 7.000 m y 23 picos por encima de 6.000 m, incluyendo 14 cimas vírgenes. Al norte se encuentra el Alatau Kirguís, o Ala-Too, las montañas sombrías, de 454 km, que hacia el este se divide en dos brazos que encierran el lago Issyk-Kul: Kungey Alatau, al norte, formando la frontera con Kazajistán, y Terksey Alatau, al sur. Separando las montañas interiores del país del valle de Fergana se encuentra la cordillera de Fergana o montañas de Fergana, de 220 km de longitud.
El Pamir forma la frontera entre Kirguistán y Tayikistán, y está representado, al sur del país, por varias sierras, entre ellas las montañas Alai y el Trans Alai, con el pico Lenin, de 7.134 m.
Hidrografía thumb|280px|Orilla meridional del lago Issyk-Kul. thumb|280px|Glaciar de Engilchek. La montaña del fondo es el Khan Tengri, de 6.995 m, en julio de 2002. En primer plano, campamento base de South Engilchek. thumb|280px|Río Chu desde el puente fronterizo de Korday, entre Kirguistán y Kazajistán. Las montañas de Kirguistán son geológicamente jóvenes, por lo que el paisaje está marcado por elevados y afilados picos separados por profundos valles. Debido a la altitud hay numerosos glaciares, entre los que destaca el glaciar Engilchek, el sexto glaciar no polar del mundo en extensión, formado por dos brazos, norte y sur, de los cuales el meridional, en las vertiente occidental del Khan Tengri, tiene 60 km de longitud, con un área de 17,2 km² y una profundidad de 150-200 m en las zonas más profundas.
Se calcula que en Kirguistán hay unos 6500 glaciares distintos, que engloban unos 650 km³ de agua y cubren unos 8.048 km². Solo hay tierra cultivable en torno a los valles de Fergana, Chuy y Talas. Hay numerosos glaciares de entre 10 y 19 km, aunque predominan los de 2,5 a 5 km de longitud en los valles pequeños, con frecuentes avalanchas de nieve.
Debido a los glaciares, Kirguistán es un país bien regado, sin embargo, ninguno de sus ríos, cortos y rápidos, es navegable. La mayor parte son tributarios del Sir Daria y tienen sus cabeceras al oeste de Tian Shan, en la frontera con China. Otra cuenca importante es la del río Chuy, que nace al norte de Tian Shan, en la garganta de Boom y desaparece en los desiertos de Kazajistán, en el desierto de Muyunkum.
El lago de Issyk-Kul, al nordeste de Kirguistán es el segundo cuerpo de agua más grande de Asia Central, después del mar de Aral, con 6.280 km², pero este lago salino, con una cuenca de 22.000 km², se contrae de forma constante y su contenido en minerales aumenta.
Kirguistán tiene un total de unos 2000 lagos con una superficie de unos 7.000 km², muchos a altitudes entre 3.000 y 4.000 m. La mayor parte de la superficie corresponde al Issyk-Kul y solo los tres más grandes después de este superan los 100 km². El segundo es el lago Song Kol (275 km²) y el tercero es el lago Chatyr-Kul (181 km²), también salino, ambos localizados en la cuenca del río Naryn.
El sobrepastoreo y la deforestación ponen en peligro la estabilidad de las vertientes, por lo que no son raros los flujos de lodo y las avalanchas. En agosto de 1992, un terremoto dejó a cientos de personas sin hogar al sudoeste de Jalal-Abad.
Recursos hídricos miniaturadeimagen|El Lago Ala-Kul parcialmente congelado La República de Kirguistán es el único Estado de Asia Central donde los recursos hídricos se generan íntegramente en su propio territorio. El agua procede de las cadenas montañosas, a menudo cubiertas de glaciares, y su abundancia es un componente vital para la agricultura y la producción de energía hidroeléctrica. La montañosa República es un "depósito de agua" esencial para la agricultura de regadío en los territorios áridos de llanura. Además, el impresionante paisaje montañoso glaciarizado implica un considerable potencial turístico. miniaturadeimagen|Río Talas Aunque por Kirguistán corre abundante agua, su suministro viene determinado por un acuerdo postsoviético de reparto entre las cinco repúblicas centroasiáticas.Como en la época soviética, Kirguistán tiene derecho al 25% del agua que nace en su territorio, pero el nuevo acuerdo permite a Turkmenistán y Uzbekistán un uso ilimitado del agua que les llega de Kirguistán, sin compensación para la nación en origen. [Durante la era soviética, Kirguistán y Tayikistán compartían sus abundantes recursos hídricos con Uzbekistán, Kazajistán y Turkmenistán durante el verano, y estas tres naciones compartían petróleo y gas con Kirguistán y Tayikistán en invierno. miniaturadeimagen|El Lago Kol-Tor Según el International Crisis Group, el sesgado sistema actual podría causar una desestabilización regional irreversible, y es necesario que los actores internacionales se ocupen de él para evitar una crisis en Asia Central. En 1994, la agricultura representaba alrededor del 88% del consumo total de agua, frente al 8% de la industria y el 4% de los sistemas municipales de distribución de agua. Según los expertos del Banco Mundial, Kirguistán dispone de un suministro adecuado de agua de alta calidad para uso futuro, siempre que el recurso se gestione con prudencia. Sin embargo, en Asia Central los problemas de agua van en aumento. La República Kirguisa exporta agua para regar los Estados vecinos, Uzbekistán, Kazajistán y Tayikistán. Para evitar conflictos, la asignación y el uso del agua, y en particular el papel de la agricultura como principal usuario de agua, se han convertido en cuestiones muy importantes en el discurso sobre el desarrollo en los últimos años, y seguirán siéndolo en el futuro.