Lys puede referirse a:

Ficción Lys, una ciudad perteneciente al mundo ficticio de la saga de novelas Canción de hielo y fuego del escritor estadounidense George R. R. Martin.

Geografía Río Lys (en neerlandés, Leie), nace en Lisbourg (Paso de Calais, Francia) y desemboca en el Escalda en Gante, Bélgica. Río Lys, en Valle de Aosta Lys, comuna francesa situada en Nièvre. Lys, comuna francesa situada en Pirineos Atlánticos.

Química Abreviatura de Lisina, aminoácido componente de las proteínas sintetizadas por los seres vivos.

Sigla LYS es el código IATA del Aeropuerto de Lyon Saint-Exupéry.