Para la Copa Mundial de Fútbol de 2006, la UEFA posee un total de catorce cupos directos, incluyendo el cupo de Alemania, reservado por ser organizador del torneo.
En la eliminatoria europea participan 51 equipos nacionales, que son divididos en 8 grupos (3 grupos de 7 integrantes; 5 grupos con 6 seleccionados). Dentro de cada grupo se realiza una liguilla con partidos de ida y vuelta.
El ganador de cada grupo se clasificaba automáticamente al Mundial. Los equipos que hayan obtenido el segundo lugar se agruparon y ordenaron en una tabla con sus puntos y diferencia de goles de los partidos de la liguilla. En los grupos de 7 integrantes no contaron los resultados con el equipo que haya obtenido el séptimo lugar del grupo. De esta nueva tabla, los dos primeros se clasificaban automáticamente a la Copa Mundial, mientras los 6 equipos restantes fueron apareados y los 3 vencedores de los partidos de ida y vuelta también participarán en el torneo.
En las tablas, los equipos en negrita se encuentran clasificados para la Copa Mundial, mientras que los que están en negrita y cursiva han pasado a través de la ronda de repesca.
Grupo 1
18 de agosto de 2004SkopieMacedonia22px3:0 (2:0)22px|Bandera de Armenia.Armenia18 de agosto de 2004BucarestRumania22px|Bandera de Rumania.2:1 (0:0)22px|Bandera de Finlandia.Finlandia4 de septiembre de 2004TampereFinlandia22px|Bandera de Finlandia.3:0 (1:0)22px|Bandera de Andorra.Andorra4 de septiembre de 2004CraiovaRumania22px|Bandera de Rumania.2:1 (1:0)22pxMacedonia8 de septiembre de 2004Andorra la ViejaAndorra22px|Bandera de Andorra.1:5 (1:3)22px|Bandera de Rumania.Rumania8 de septiembre de 2004ÁmsterdamPaíses Bajos22px|Bandera de los Países Bajos.2:0 (1:0)22px|Bandera de República Checa.República Checa8 de septiembre de 2004ErevánArmenia22px|Bandera de Armenia.0:2 (0:1)22px|Bandera de Finlandia.Finlandia9 de octubre de 2004PragaRepública Checa22px|Bandera de República Checa.1:0 (1:0)22px|Bandera de Rumania.Rumania9 de octubre de 2004TampereFinlandia22px|Bandera de Finlandia.3:1 (2:1)22px|Bandera de Armenia.Armenia9 de octubre de 2004SkopieMacedonia22px2:2 (1:1)22px|Bandera de los Países Bajos.Países Bajos13 de octubre de 2004Andorra la ViejaAndorra22px|Bandera de Andorra.1:0 (0:0)22pxMacedonia13 de octubre de 2004ErevánArmenia22px|Bandera de Armenia.0:3 (0:2)22px|Bandera de República Checa.República Checa13 de octubre de 2004ÁmsterdamPaíses Bajos22px|Bandera de los Países Bajos.3:1 (2:1)22px|Bandera de Finlandia.Finlandia17 de noviembre de 2004SkopieMacedonia22px0:2 (0:0)22px|Bandera de República Checa.República Checa17 de noviembre de 2004ErevánArmenia22px|Bandera de Armenia.1:1 (0:1)22px|Bandera de Rumania.Rumania17 de noviembre de 2004Barcelona (España)Andorra22px|Bandera de Andorra.0:3 (0:2)22px|Bandera de los Países Bajos.Países Bajos9 de febrero de 2005SkopieMacedonia22px0:0 (0:0)22px|Bandera de Andorra.Andorra26 de marzo de 2005TepliceRepública Checa22px|Bandera de República Checa.4:3 (2:0)22px|Bandera de Finlandia.Finlandia26 de marzo de 2005ErevánArmenia22px|Bandera de Armenia.2:1 (1:0)22px|Bandera de Andorra.Andorra26 de marzo de 2005BucarestRumania22px|Bandera de Rumania.0:2 (0:1)22px|Bandera de los Países Bajos.Países Bajos30 de marzo de 2005SkopieMacedonia22px1:2 (1:1)22px|Bandera de Rumania.Rumania30 de marzo de 2005Andorra la ViejaAndorra22px|Bandera de Andorra.0:4 (0:2)22px|Bandera de República Checa.República Checa30 de marzo de 2005EindhovenPaíses Bajos22px|Bandera de los Países Bajos.2:0 (2:0)22px|Bandera de Armenia.Armenia4 de junio de 2005ErevánArmenia22px|Bandera de Armenia.1:2 (0:1)22pxMacedonia4 de junio de 2005RóterdamPaíses Bajos22px|Bandera de los Países Bajos.2:0 (1:0)22px|Bandera de Rumania.Rumania4 de junio de 2005LiberecRepública Checa22px|Bandera de República Checa.8:1 (3:1)22px|Bandera de Andorra.Andorra8 de junio de 2005HelsinkiFinlandia22px|Bandera de Finlandia.0:4 (0:1)22px|Bandera de los Países Bajos.Países Bajos8 de junio de 2005ConstanzaRumania22px|Bandera de Rumania.3:0 (2:0)22px|Bandera de Armenia.Armenia8 de junio de 2005TepliceRepública Checa22px|Bandera de República Checa.6:1 (2:1)22pxMacedonia17 de agosto de 2005SkopieMacedonia22px0:3 (0:0)22px|Bandera de Finlandia.Finlandia17 de agosto de 2005ConstanzaRumania22px|Bandera de Rumania.2:0 (2:0)22px|Bandera de Andorra.Andorra3 de septiembre de 2005ConstanzaRumania22px|Bandera de Rumania.2:0 (1:0)22px|Bandera de República Checa.República Checa3 de septiembre de 2005ErevánArmenia22px|Bandera de Armenia.0:1 (0:0)22px|Bandera de los Países Bajos.Países Bajos3 de septiembre de 2005Andorra la ViejaAndorra22px|Bandera de Andorra.0:022px|Bandera de Finlandia.Finlandia7 de septiembre de 2005EindhovenPaíses Bajos22px|Bandera de los Países Bajos.4:0 (3:0)22px|Bandera de Andorra.Andorra7 de septiembre de 2005OlomoucRepública Checa22px|Bandera de República Checa.4:1 (0:0)22px|Bandera de Armenia.Armenia7 de septiembre de 2005TampereFinlandia22px|Bandera de Finlandia.5:1 (3:0)22pxMacedonia8 de octubre de 2005PragaRepública Checa22px|Bandera de República Checa.0:2 (0:0)22px|Bandera de los Países Bajos.Países Bajos8 de octubre de 2005HelsinkiFinlandia22px|Bandera de Finlandia.0:1 (0:1)22px|Bandera de Rumania.Rumania12 de octubre de 2005HelsinkiFinlandia22px|Bandera de Finlandia.0:3 (0:1)22px|Bandera de República Checa.República Checa12 de octubre de 2005Andorra la ViejaAndorra22px|Bandera de Andorra.0:3 (0:1)22px|Bandera de Armenia.Armenia12 de octubre de 2005ÁmsterdamPaíses Bajos22px|Bandera de los Países Bajos.0:022pxMacedonia
Grupo 2
4 de septiembre de 2004CopenhagueDinamarca22px|Bandera de Dinamarca.1:1 (1:0)22px|Bandera de Ucrania.Ucrania4 de septiembre de 2004TrabzonTurquía22px|Bandera de Turquía.1:1 (0:0)22px|Bandera de Georgia.Georgia4 de septiembre de 2004TiranaAlbania22px|Bandera de Albania2:1 (2:1)22px|Bandera de Grecia.Grecia8 de septiembre de 2004TiflisGeorgia22px|Bandera de Georgia.2:0 (1:0)22px|Bandera de AlbaniaAlbania8 de septiembre de 2004AlmatyKazajistán22px|Bandera de Kazajistán.1:2 (1:1)22px|Bandera de Ucrania.Ucrania8 de septiembre de 2004El PireoGrecia22px|Bandera de Grecia.0:0 (0:0)22px|Bandera de Turquía.Turquía9 de octubre de 2004KievUcrania22px|Bandera de Ucrania.1:1 (0:0)22px|Bandera de Grecia.Grecia9 de octubre de 2004EstambulTurquía22px|Bandera de Turquía.4:0 (1:0)22px|Bandera de Kazajistán.Kazajistán9 de octubre de 2004TiranaAlbania22px|Bandera de Albania0:2 (0:0)22px|Bandera de Dinamarca.Dinamarca13 de octubre de 2004LeópolisUcrania22px|Bandera de Ucrania.2:0 (1:0)22px|Bandera de Georgia.Georgia13 de octubre de 2004AlmatyKazajistán22px|Bandera de Kazajistán.0:1 (0:0)22px|Bandera de AlbaniaAlbania13 de octubre de 2004CopenhagueDinamarca22px|Bandera de Dinamarca.1:1 (1:0)22px|Bandera de Turquía.Turquía17 de noviembre de 2004El PireoGrecia22px|Bandera de Grecia.3:1 (2:0)22px|Bandera de Kazajistán.Kazajistán17 de noviembre de 2004TiflisGeorgia22px|Bandera de Georgia.2:2 (1:1)22px|Bandera de Dinamarca.Dinamarca17 de noviembre de 2004EstambulTurquía22px|Bandera de Turquía.0:3 (0:2)22px|Bandera de Ucrania.Ucrania9 de febrero de 2005El PireoGrecia22px|Bandera de Grecia.2:1 (2:1)22px|Bandera de Dinamarca.Dinamarca9 de febrero de 2005TiranaAlbania22px|Bandera de Albania0:2 (0:1)22px|Bandera de Ucrania.Ucrania26 de marzo de 2005CopenhagueDinamarca22px|Bandera de Dinamarca.3:0 (2:0)22px|Bandera de Kazajistán.Kazajistán26 de marzo de 2005TiflisGeorgia22px|Bandera de Georgia.1:3 (1:2)22px|Bandera de Grecia.Grecia26 de marzo de 2005EstambulTurquía22px|Bandera de Turquía.2:0 (2:0)22px|Bandera de AlbaniaAlbania30 de marzo de 2005KievUcrania22px|Bandera de Ucrania.1:0 (0:0)22px|Bandera de Dinamarca.Dinamarca30 de marzo de 2005TiflisGeorgia22px|Bandera de Georgia.2:5 (2:3)22px|Bandera de Turquía.Turquía30 de marzo de 2005El PireoGrecia22px|Bandera de Grecia.2:0 (1:0)22px|Bandera de AlbaniaAlbania4 de junio de 2005KievUcrania22px|Bandera de Ucrania.2:0 (1:0)22px|Bandera de Kazajistán.Kazajistán4 de junio de 2005TiranaAlbania22px|Bandera de Albania3:2 (2:0)22px|Bandera de Georgia.Georgia4 de junio de 2005EstambulTurquía22px|Bandera de Turquía.0:0 (0:0)22px|Bandera de Grecia.Grecia8 de junio de 2005AlmatyKazajistán22px|Bandera de Kazajistán.0:6 (0:3)22px|Bandera de Turquía.Turquía8 de junio de 2005CopenhagueDinamarca22px|Bandera de Dinamarca.3:1 (1:0)22px|Bandera de AlbaniaAlbania8 de junio de 2005El PireoGrecia22px|Bandera de Grecia.0:1 (0:0)22px|Bandera de Ucrania.Ucrania17 de agosto de 2005AlmatyKazajistán22px|Bandera de Kazajistán.1:2 (1:0)22px|Bandera de Georgia.Georgia3 de septiembre de 2005TiranaAlbania22px|Bandera de Albania2:1 (0:0)22px|Bandera de Kazajistán.Kazajistán3 de septiembre de 2005EstambulTurquía22px|Bandera de Turquía.2:2 (1:1)22px|Bandera de Dinamarca.Dinamarca3 de septiembre de 2005TiflisGeorgia22px|Bandera de Georgia.1:1 (0:1)22px|Bandera de Ucrania.Ucrania7 de septiembre de 2005AlmatyKazajistán22px|Bandera de Kazajistán.1:2 (0:0)22px|Bandera de Grecia.Grecia7 de septiembre de 2005CopenhagueDinamarca22px|Bandera de Dinamarca.6:1 (3:1)22px|Bandera de Georgia.Georgia7 de septiembre de 2005KievUcrania22px|Bandera de Ucrania.0:1 (0:0)22px|Bandera de Turquía.Turquía8 de octubre de 2005TiflisGeorgia22px|Bandera de Georgia.0:022px|Bandera de Kazajistán.Kazajistán8 de octubre de 2005CopenhagueDinamarca22px|Bandera de Dinamarca.1:0 (1:0)22px|Bandera de Grecia.Grecia8 de octubre de 2005DnipropetrovskUcrania22px|Bandera de Ucrania.2:2 (1:0)22px|Bandera de AlbaniaAlbania12 de octubre de 2005AlmatyKazajistán22px|Bandera de Kazajistán.1:2 (0:0)22px|Bandera de Dinamarca.Dinamarca12 de octubre de 2005AtenasGrecia22px|Bandera de Grecia.1:0 (1:0)22px|Bandera de Georgia.Georgia12 de octubre de 2005TiranaAlbania22px|Bandera de Albania0:1 (0:1)22px|Bandera de Turquía.Turquía
Grupo 3