El Jaguares de Chiapas Fútbol Club, alguna vez conocido también como Chiapas Fútbol Club o Jaguares Fútbol Club, es un equipo de fútbol mexicano con sede en la ciudad de Tuxtla Gutiérrez, capital del estado de Chiapas.

Participó en la Primera División de México, desde el 3 de agosto de 2002 hasta el 6 de mayo de 2017, cuando descendió. El 8 de junio de 2017, la FEMEXFUT anunció la desafiliación del cuadro chiapaneco por adeudos.

Después de siete años de ausencia, en el verano del 2024 se dio a conocer que el equipo volvería a competir en el fútbol profesional, pero en esta ocasión lo haría en la Serie A de la Liga Premier, el tercer nivel del fútbol mexicano, a partir de la temporada 2024-2025.

Historia 200px|thumb|El jaguar fue elegido como mascota oficial por ser representativo de la cultura de Chiapas.

Los Tiburones Rojos de Veracruz (Campeón en el Invierno 2001, Primera División 'A') perdieron ante San Luis FC (Campeón en el Verano 2002, Primera A), la posibilidad de ascender a la Primera División, pero jugaron una promoción contra el Club León (el cuadro Esmeralda ocupó el último lugar de la tabla porcentual de la Primera División). El juego de ida se celebró el 29 de mayo de 2002 en el Estadio Luis "Pirata" Fuente, los Tiburones Rojos ganaron 3-1; el 1 de junio, en el juego de vuelta, el marcador fue 0-0, así lograron el ascenso y con esto, por un breve período el puerto jarocho contó con dos equipos en el Máximo Circuito, pues 6 meses antes el Club Irapuato había sido trasladado a Veracruz por motivos administrativos.

Grupo Pegaso, decidió respetar el ascenso del cuadro original de los Tiburones Rojos y mover la franquicia que durante la temporada 2001-2002, ocupó las plazas de Irapuato y Veracruz.

El 27 de junio de 2002, en el Centro de Convenciones del Polifórum Mesoamericano, en Tuxtla Gutiérrez, Alejandro Burillo Azcárraga –Presidente de Grupo Pegaso–, en compañía de Pablo Salazar Mendiguchía –Gobernador del estado– y directivos de fútbol, anunció que el estado de Chiapas tendría un equipo de fútbol en la Primera División, el cual se llamaría Jaguares de Chiapas FC.

«El proyecto que el Grupo Pegaso inicia hoy en Chiapas es mucho más que un proyecto de fútbol, es un proyecto de vida, de futuro, deportivo, social, económico...», mencionó el gobernador ante la presencia de Alejandro Burrillo Azcárraga, Miguel Ángel Couchonal y José Antonio García.

Debut en Primera División: 2002-2003

El calendario indicaba que el debut de Jaguares sería en casa, recibiendo a Tigres de la UANL, pero la remodelación y ampliación del Estadio Víctor Manuel Reyna, aún no había concluido; al final se determinó que el Estadio Azul albergaría el encuentro.

El 3 de agosto a las 19:00 h (tiempo local), los Jaguares debutaron en la Primera División de México. Salvador Capitano, primer entrenador del club chiapaneco, mandó a la cancha a: Adrián Zermeño, Omar Monjaraz, Pedro "Cabo" Sarabia, Miguel "Jalisco" Gutiérrez, Ricardo Cadena, Joaquín Hernández, Joaquín "Jaibo" del Olmo, Carlos Sánchez Laureano, Jesús Córdoba, Gustavo "Gusano" Nápoles y Julio César Yegros.

El partido finalizó con marcador de 1-3 a favor de Tigres; el primer gol en la historia de Jaguares fue obra del argentino Lucio Filomeno, a 8 minutos de terminar el encuentro.

Tras un empate ante Tuzos del Pachuca en el Estadio Hidalgo, llegaría la Jornada 3 y el Estadio Zoque acogería por primera ocasión un partido del Máximo Circuito; el 17 de agosto a las 15:30 h (tiempo local), Jaguares recibió al Club Deportivo Guadalajara; el marcador finalizó 1-1, Omar Bravo adelantó a las Chivas Rayadas, en tanto que Felipe Ayala, anotó el gol del empate al minuto 62.

En la Jornada 4, los Jaguares vencieron en calidad de visitante a San Luis FC (0-1, gol de Lucio Filomeno al minuto 61), consiguiendo así su primer triunfo en la historia. En la siguiente Jornada, en casa, doblegaron 2-0 a Club Santos Laguna.

En la Jornada 12, Jaguares visitó a Toluca y se fue adelante en el marcador con tanto de Joaquín "Jaibo" del Olmo, gol que significó el número 50 mil en la historia de los campeonatos mexicanos; al final, los Diablos Rojos ganaron 5-1.

Después de 12 Jornadas y tras obtener 10 de 36 puntos en disputa, Salvador Capitano fue cesado y su lugar fue ocupado por el estratega chileno Jorge Garcés (extécnico del seleccionado de su país).

Al concluir el Apertura 2002, Jaguares se ubicó en el lugar 19 –de 20 equipos–, sumando 16 puntos producto de 3 victorias, 7 empates y 9 derrotas; Julio César Yegros y Alejandro "Hueso" Glaría, fueron los mejores anotadores con 5 goles cada uno.

En el Clausura 2003, un equipo habría de descender a la Primera División 'A', así que Jaguares, Club Puebla y Colibríes de Morelos, pelearían por su permanencia.

Después de 9 Jornadas y tras conseguir únicamente 8 puntos, "El Peineta" Garcés fue cesado y Sergio Bueno (en compañía de René Isidoro García –auxiliar– y Jorge Víctor Franco –preparador físico–), fue presentado como el nuevo timonel de los felinos.

Los resultados no fueron los mejores y tras perder un duelo vital contra Colibríes en el Estadio Zoque (0-1), Jaguares tenía la necesidad de sumar los últimos 6 puntos en disputa para salvarse y además, que los de Morelos no sumaran más. Finalmente, las combinaciones se dieron y Jaguares venció de visitante a Cruz Azul (0-1, gol de Lucio Filomeno al minuto 9) y en el Zoque, derrotó 1-0 a Tecos (gol de Gilberto Mora al minuto 84); en tanto que Colibríes perdió de visita ante Morelia (3-1) y empató 0-0 contra Cruz Azul, en el Estadio Mariano Matamoros.

Al finalizar el torneo, Jaguares se ubicó en el lugar 17 –de 20 equipos– de la tabla general, sumando 19 puntos, producto de 5 victorias, 4 empates y 10 derrotas; en la tabla de cocientes, el club ocupó la posición número 18, por arriba de Club Puebla (19) y Colibríes (20).

2003-2006

El 5 de julio de 2003, José Luis Trejo (Juan Manuel Álvarez –auxiliar– e Iván Quintana –preparador físico–), asumió el cargo de director técnico de Jaguares de Chiapas.

Omar "Gato" Ortiz, Francisco Muñoz Barba, Sergio Almaguer, Luis Romero, Francisco "Burra" Ramírez, Salvador Vaca, Jorge Manrique, Néstor Gutiérrez, José de Jesús "Chuy" Gutiérrez, David "Popeye" Oliva, Joel "Huevo" Soto, Fernando Martell y Salvador Cabañas, se sumaron al equipo.

En el verano del 2003, en el césped del Estadio Zoque, se celebró la primera edición de la Copa Chiapas, en donde el club anfitrión venció en la final a los Potros de Hierro del Atlante por marcador de 4-1.

Al concluir el Apertura 2003, Jaguares se ubicó en el lugar 16 –de 20 equipos– de la tabla general, sumando 21 puntos, producto de 5 victorias, 6 empates y 9 derrotas.

En diciembre de 2003, Jaguares fue vendido por Grupo Pegaso a empresarios locales, encabezados por Antonio Leonardo Castañón (CEO de Farmacias del Ahorro).

Para el siguiente torneo, al equipo llegaron: Adrián García Arias, Omar Rodríguez, Heriberto Morales, Irving Rubirosa, Everaldo Barbosa, Luis Hernández y Sebastiao Pereira "Didí".

En el Clausura 2004, Jaguares de Chiapas fue líder del certamen y consiguió llegar a 17 partidos sin perder, sumando 42 de 57 puntos posibles, producto de 12 victorias, 6 empates y una derrota (de último minuto ante Toluca, en la Jornada 2), anotando 35 goles y recibiendo 20.

Salvador Cabañas fue sublíder de goleo –junto a Robert de Pinho (Atlas)–, al marcar 15 tantos; Bruno Marioni (UNAM) y Andrés Silvera (Tigres), fueron campeones de goleo al realizar 16 dianas.

En 4tos. de final, Jaguares perdió ante Cruz Azul por marcador global de 4-3 (Estadio Azul 2-1 y Estadio Zoque 2-2).

Del 2 al 12 de enero de 2005, Jaguares participó en la segunda edición del torneo InterLiga (certamen que otorgaba 2 pases a la Copa Libertadores). El cuadro chiapaneco fue líder del grupo B al sumar 6 puntos y disputó la final ante las Chivas Rayadas del Guadalajara; en tiempo regular el partido finalizó 1-1, pero en tanda de penales Chivas ganó 5-3 y se clasificó como México 3 a la Libertadores.

El 14 de febrero de 2005, José Luis Trejo renunció a la dirección técnica del equipo. El 16 de febrero, Antonio Mohamed fue nombrado entrenador del club, cargo que ocuparía hasta el 2 de abril. El 5 de abril, Fernando Quirarte (Eduardo Ramos y Víctor Rangel –auxiliares– y Axel Bierbaum –preparador físico–) fue presentado como el nuevo estratega felino.

El 12 de septiembre, la directiva de Jaguares informó el cese del "Sheriff" Quirarte, tras los resultados obtenidos en el inicio del torneo (sumó 4 de 21 puntos); al día siguiente, Luis Fernando Tena fue anunciado como director técnico del club (Héctor Islas y Ricardo Campos –auxiliares–).

El 15 de octubre de 2005, en el Zoque, Jaguares con 10 elementos por 55 minutos (tras la expulsión de Felipe Ayala), se impuso 4-3 al Club América, vigente Campeón y con una racha de 28 partidos sin derrota en el fútbol mexicano.

Al finalizar el Apertura 2005, Jaguares fue tercero del grupo y se ubicó en el puesto 8 de la tabla general, sumando 23 puntos, producto de 5 victorias, 8 empates y 4 derrotas, pero no accedió a la liguilla ya que le descontaron 3 puntos (porque el equipo no cumplió con los minutos requeridos por la regla 20/11).

Al concluir el Clausura 2006, los Naranjas fueron sublíderes al contabilizar 30 puntos, producto de 9 victorias, 3 empates y 5 derrotas. Salvador Cabañas fue líder de goleo, junto a Sebastián Abreu (jugador de Dorados de Sinaloa), al marcar 11 tantos.

En la liguilla, Jaguares se enfrentó a Guadalajara. En el juego de ida, celebrado en el Estadio Jalisco, Jaguares derrotó 2-3 a Chivas; en el partido de vuelta, en el Zoque al minuto 90, Johnny García anotó el gol que dejaba 6-5 el global a favor de las Chivas Rayadas y una nueva eliminación para el cuadro chiapaneco.

2006-2009

El 23 de mayo de 2006, la directiva del club anunció que Eduardo de la Torre Menchaca sería el nuevo técnico del equipo, de cara al Apertura 2006, en sustitución de Luis Fernando Tena, quien se marchó al Club América, junto a Salvador Cabañas.

Con el "Yayo" de la Torre, se incorporaron los futbolistas Christian Armas, Edoardo Isella, Javier Saavedra, Alejandro Corona, Óscar Emilio Rojas, Alejandro Vela y Ulises Mendívil.

En el Apertura 2006, Jaguares culminó en la posición 10 de la tabla general, sumando 23 puntos, producto de 6 victorias, 5 empates y 6 derrotas, disputando el repechaje ante Toluca; en el global, los Diablos Rojos vencieron 2-1 a los Naranjas (Estadio Zoque 1-1 y Estadio Nemesio Díez 1-0).

Del 3 al 13 de enero de 2007, Jaguares participó en la cuarta edición del torneo InterLiga. El cuadro chiapaneco fue sublíder del grupo B al sumar 4 puntos y disputó la final ante Club Necaxa; en tiempo regular, los Rayos ganaron 1-0 y se clasificaron como México 2 a la Copa Libertadores.

El 16 de febrero de 2007, Antonio Leonardo Castañón presentó a Víctor Manuel Vucetich, como nuevo timonel del equipo.

El 29 de abril de 2007, en la última Jornada del Clausura 2007, Chiapas recibió a Guadalajara; Javier Cámpora (Jaguares) con 10 goles y Omar Bravo (Chivas Rayadas) con 11 tantos, llegaban al Estadio Zoque con la posibilidad de obtener el título de goleo. Chiapas ganó 1-0 con anotación de Gilberto Mora; al final, Bravo se quedó con el galardón.

El 12 de septiembre de 2007, René Isidoro García asumió el cargo de entrenador de Jaguares, en sustitución del "Rey Midas" Vucetich.

El 20 de febrero de 2008, el exjugador y directivo felino Sergio Almaguer, fue presentado como entrenador del cuadro chiapaneco.

Bajo la tutela del "Potro" Almaguer, Jaguares finalizó el Clausura 2008 en la posición 6 de la tabla general, sumando 26 puntos, producto de 7 victorias, 5 empates y 5 derrotas. En la liguilla, se enfrentaron a Cruz Azul en 4tos. de final; en el juego de ida, Jaguares venció 1-0 a la Máquina Celeste y en la vuelta, el Cruz Azul ganó 2-1; el global fue 2-2, pero la mejor posición en la tabla le dio el pase a la Máquina Celeste.