Sonderkommando tarkoittaa saksan kielessä erikoistehtävää tai komennusta, tai niihin määrättyjä henkilöitä. Natsi-Saksan sonderkommandoja olivat esimerkiksi:
tuhoamisleirien Sonderkommandot, vankiryhmiä, joiden tehtävänä oli avustaa toisten vankien tappamisessa Sonderkommando Nord, erikoisyksikkö, jonka tehtävänä oli johtaa ja tukea Suomessa toimivaa saksalaismielistä vastarintaliikettä