Le mot homologie est employé dans plusieurs domaines :
en mathématiques, homologie homologie et cohomologie, homologie singulière, homologie de Morse, homologie de Floer, homologie des groupes, homologie (transformation géométrique) ;
en biologie de l'évolution, une homologie désigne un même caractère observé chez deux espèces différentes, qui a été hérité d'un ancêtre commun mais dont la fonction chez chacune des espèces n'est pas forcément la même ; en biologie cellulaire, l'homologie des chromosomes d'origine paternelle et maternelle ; en biochimie, on parle de modélisation de protéines par homologie ; en chimie, homologie, relatif aux molécules homologues.