vignette|Jaunissement mortel du palmier. Les phytoplasmes sont des bactéries, de la famille des , infectant les plantes. ce sont des bactéries pléiomorphes du fait de leur absence de paroi. Ce sont des pathogènes des plantes que ces bactéries infectent via un vecteur comme la cicadelle.
Description Dépourvus de paroi cellulaire rigide, les phytoplasmes sont délimités par une double membrane et n'ont pas de forme spécifique, ce sont des procaryotes pléiomorphes. Ils appartiennent à la classe des Mollicutes. À leur découverte ils ont été nommés MLO (abréviation de Mycoplasma Like Organism) en raison de leur ressemblance (en microscopie électronique) avec les mycoplasmes.
Ils sont à l’origine de nombreuses maladies bactériennes des plantes telles que la phyllodie par exemple. Ils sont transmis par des insectes vecteurs, le plus souvent des cicadelles. La croissance intracellulaire se fait dans les glandes salivaires, le tractus intestinal, l'hémolymphe. Le temps de latence avant la transmission varie de 10 à 45 jours suivant la température. Parfois on note une longévité des vecteurs un peu réduite.
L'acquisition des phytoplasmes est rendue plus efficace par les larves. Les symptômes (phytoplasmes) peuvent être la jaunisse foliaire, le nanisme, la phyllodie, la virescence ou l'apparition de proliférations appelées « balai de sorcière ». Ils se multiplient exclusivement dans les tubes criblés du phloème de leurs hôtes.
Exemple de la prolifération du pommier La prolifération du pommier est une maladie anciennement connue mais discrète ces dernières années, qui connaît actuellement une certaine recrudescence. Elle est due à un phytoplasme transmis par au moins une espèce de psylle. Sa recrudescence est probablement liée à l'allègement des traitements insecticides polyvalents dans le cadre de la lutte intégrée, dans les vergers mais aussi leur environnement. Une fois la maladie identifiée (examen des symptômes et vérification au laboratoire), le seul moyen de lutte est l'arrachage des arbres.
Taxonomie Les phytoplasmes appartiennent à l'ordre monophylétique des . En 1992, étant donné que ces bactéries infectent des plantes, le sous-comité de taxonomie des Mollicutes du Comité international de systématique des procaryotes a proposé d'employer le nom de Phytoplasma au lieu du terme pseudo-mycoplasme ou MLO (mycoplasma-like organism) « en référence aux mollicutes phytopathogènes ».. Le nom générique Phytoplasma fut adopté en 2004. Il reste encore actuellement, en , sous le statut de Candidatus., qui est employé pour désigner les bactéries qui ne peuvent être cultivées. Sa taxonomie est compliquée car il ne peut pas être cultivé, donc les méthodes normalement utilisées pour la classification des procaryotes ne sont pas possibles.. Cela complique également le séquençage de ces bactéries car elles sont intracellulaires. Il faut donc déterminer des amorces de séquençage très spécifiques. Des groupes taxonomiques ont pu être établis grâce à la méthode PAUP et le séquençage de l'ARNr 16S et des régions intergéniques 16S-23S.
La classification des phytoplasmes en groupes taxonomiques a été fondée sur des différences de taille des fragments produits par la digestion de restriction de la séquence du gène 16S ARNr (RFLP) ou par comparaison de séquences d'ADN des régions de l'espaceur 16s / 23s..
Des désaccords subsistent sur le nombre de groupes taxonomiques des phytoplasmes, des travaux faisant appel à la simulation par ordinateur des restrictions de digestion du gène 16S ARNr suggèrent qu'il pourrait y avoir jusqu'à 28 groupes., tandis que d'autres articles plaident pour moins de groupes, mais plus de sous-groupes. Chaque groupe comprend au moins une espèce de "Candidatus Phytoplasma" caractérisée par des propriétés distinctives biologiques, phytopathologies et génétiques.
Quelques espèces et les maladies provoquées Il existe selon 74 espèces potentielles (moins sept espèces mal nommées et 4 espèces synonymes). Liste des espèces de "Ca. Phytoplasma", principaux groupes et sous-groupes publiés avec leurs noms communs et numéros d'accession GenBank de la séquence du gène 16S ARNr.
Nota : les espèces de "Ca. Phytoplasma" indiquées entre crochets sont provisoires (similarité des séquence du 16S ARNr inférieure à 97,5 %) et non encore publiées séparément comme espèces nouvelles.« Indéterminé » indique les espèces de "Ca. Phytoplasma" pour lesquelles le classement dans un groupe ou sous-groupe est en attente.« Non assigné » indique les espèces de "Ca. Phytoplasma" dont le statut est en attente (similarité des séquence du 16S ARNr supérieure à 97,5 %) car les symptômes présentés par la plante ou l'insecte hôtes sont significativement différents lorsqu'ils sont infectés par la souche du phytoplasme décrite comparée à une souche de la même espèce ou du même groupe.
N°Nom communEspèce de "Ca. Phytoplasma"Groupe / sous-groupeNuméro d'accessionRéférence1 Maladie d'Awka [Ca. P. cocosnigeriae] 16Sr XXII-A Y14175 Firrao, 20042 Tanzanian lethal disease [Ca. P. cocostanzaniae] indéterminé X80117 Firrao, 20043 Loofah witches' broom [Ca. P. luffae] 16Sr VIII-A AF086621 Firrao, 20044 Jaunisse létale du palmier [Ca. P. palmae] 16Sr IV-A U18747 Firrao, 20045 Maladie X [Ca. P. pruni] 16Sr III-A L04682 Firrao, 20046 Stolbur [Ca. P. solani] 16Sr XII-A AF248959 Firrao, 20047 Flavescence dorée [Ca. P. vitis] 16Sr V-C AF176319 Firrao, 20048 Papaya yellow crinkle Ca. P. aurantifolia 16Sr II-D Y10097 Davis et al., 19979 Allocasuarina yellows Ca. P. allocasuarinae indéterminé AY135523 Marcone et al., 200410 Flétrissement violacé de la pomme de terre Ca. P. americanum 16Sr XVIII DQ174122 Lee et al., 200611 Lime witches' broom Ca. P. aurantifolia 16Sr II-B U15442 Zriek et al., 199512 Jaunisse de la vigne Ca. P. australience 16Sr XII L76865 Davis et al., 199713 Balanites witches' broom Ca. P. balanitae 16Sr V AB689678 Win et al., 201214 Hibiscus witches' broom Ca. P. brasiliense 16Sr XV AF147708 Montano et al., 200115 Papaya bunchy top Ca. P. caricae 16Sr XVII AY725234 Arocha et al., 200516 Balai de sorcière du châtaignier Ca. P. castaneae 16Sr XIX AB054986 Jung et al., 200217 Jaunisse du liseron Ca. P. convolvuli 16Sr XII JN833705 Martini et al., 201218 Soybean stunt Ca. P. costaricanum 16Sr XXXI HQ225630 Lee et al., 201119 Feuilles blanches de la canne à sucre Ca. P. cynodontis 16Sr XI AB052874 Jung et al., 200320 Areca palm yellow leaf Ca. P. cynodontis 16Sr XI-A JN967909 Ramaswamy et al., 201221 Feuilles blanches de la canne à sucre Ca. P. cynodontis 16Sr XI-C X76432 Lee et al., 199822 Leafhopper bourne BVK Ca. P. cynodontis 16Sr XIV X76429 Semuller et al., 200423 Bermuda grass white leaf Ca. P. cynodontis 16Sr XIV AJ550985 Marcone et al., 200424 Cynodon white leaf Ca. P. cynodontis indéterminé AF509321 Blanche et al., 200325 Sorghum grassy shoot Ca. P. cynodontis indéterminé AF509324 Blanche et al., 200326 Sorghum grassy shoot Ca. P. cynodontis indéterminé AF509325 Blanche et al., 200327 Balai de sorcière du fraisier Ca. P. fragariae 16Sr XII-E DQ086423 Valiunas et al., 200628 Jaunisse du frêne Ca. P. fraxini 16Sr VII-A AF092209 Griffiths et al., 199929 Sugarcane Yellow Leaf Ca. P. graminis 16Sr XVI AY725228 Arocha et al., 200530 Hydrangea phyllody Ca. P. japonicum 16Sr XII-D AB010425 Sawayanagi et al., 199931 Parsley leaf of tomato Ca. P. lycopersici indéterminé EF199549 Arocha et al., 200732 Periwinkle phyllody Ca. P. malasianum 16Sr XXXII EU371934 Nejat et al., 201233 Prolifération du pommier Ca. P. mali 16Sr X-A AJ542541 Semuller et al., 200434 Cassia italica witches' broom Ca. P. omanense 16Sr XXIX EF666051 Saddy et al., 200835 Nanisme jaune du riz Ca. P. oryzae 16Sr XI-A D12581 Namba et al., 200936 Nanisme jaune du riz Ca. P. oryzae 16Sr XI-A AB052873 Jung et al., 200337 Almond lethal disease Ca. P. phoenicium 16Sr IX-D AF515636 Verdin et al., 200338 Pine shoot proliferation Ca. P. pini 16Sr XXI AJ632155 Schneider et al., 200539 Maladie X Ca. P. pruni 16Sr III-A JQ044393 Davis et al., 201240 European stone fruit Ca. P. prunorum 16Sr X-F AJ542544 Semuller et al., 200441 Dépérissement du poirier Ca. P. pyri 16Sr X-C AJ542543 Semuller et al., 200442 Buckthorn witches' broom Ca. P. rhamni 16Sr XX X76431 Marcone et al., 200443 Rubus stunt Ca. P. rubi 16Sr V AY197648 Maher et al., 201144 Bois noir Ca. P. solani 16Sr XII JQ730746 Quaglino et al., 201345 Spartium witches' broom Ca. P. spartii 16Sr X-D X92869 Marcone et al., 200446 Balai de sorcière de la passiflore Ca. P. sudamericanum 16Sr III-V GU292082 Davis et al., 201247 Balai de sorcière de la passiflore Ca. P. sudamericanum 16Sr VI GU292081 Davis et al., 201248 Salt cedar witches' broom Ca. P. tamaricis 16Sr XXX FJ432664 Zhao et al., 200949 Prolifération du trèfle Ca. P. trifolii 16Sr VI-A AY390261 Hiruki et al., 200450 Jaunisse de l'orme Ca. P. ulmi 16Sr V-A AY197655 Lee et al., 200451 Balai de sorcière du jujubier Ca. P. ziziphi 16Sr V-B AB052876 Jung et al., 200352 Jaunisse de l'aster Ca. P. asteris 16Sr I M30790 Lee et al., 200453 Virescence de la pervenche mexicaine non assigné 16Sr XIII-A AF248960 Wei et al. 200754 Bermuda grass white leaf non assigné 16Sr XIV AJ550984 Marcone et al., 200455 Jaunisse de la vigne (Grapevine yellow) non assigné 16Sr XXIII-A AY083605 Wei et al., 200756 Sorghum bunchy shoot non assigné 16Sr XXIV-A AF509322 Wei et al., 200757 Weeping tea witches' broom non assigné 16Sr XXV-A AF521672 Wei et al., 200758 Jaunisse de la canne à sucre non assigné 16Sr XXVI-A AJ539179 Wei et al., 200759 Jaunisse de la canne à sucre non assigné 16Sr XXVII-A AJ539180 Wei et al., 200760 Derbid phytoplasma non assigné 16Sr XXVIII-A AY744945 Wei et al., 200761 Chinaberry yellows non assigné indéterminé AF495882 Wei et al., 2007
Notes et références
Voir aussi Articles connexes Jaunisse de l'aster Flavescence dorée Bois noir Stolbur Liens externes
Catégorie:Bactérie phytopathogène Catégorie:Agent pathogène des plantes Catégorie:Acholeplasmataceae Catégorie:Bactérie (nom vernaculaire)