A 2009–2010-es Európa-liga csoportkörének mérkőzéseit 2009. szeptember 17-e és december 17-e között játszották.
A csoportkörben a 2009–2010-es Európa-liga rájátszásának 38 győztes, illetve a 2009–2010-es UEFA-bajnokok ligája rájátszásának 10 vesztes csapata vett részt. A 12, egyaránt négycsapatos csoportban körmérkőzéses, oda-visszavágós rendszerben mérkőztek meg a csapatok egymással. A csoportok első két helyén végzett csapatai jutottak az egyenes kieséses szakaszba.
Kiemelés A csapatok kiemelését a nemzeti labdarúgó-bajnokságokra vonatkoztatott UEFA-együttható alapján végezték, majd négy, egyaránt 12 résztvevős csoportra bontották.
1. kalapCsapat Koeff. Sahtar DoneckCV 74,370 Werder Bremen 91,339 Villarreal CF 80,853 AS Roma 78,582 PSV Eindhoven 75,826 Sporting CP 68,292 Hamburger SV 67,339 Benfica 64,292 Valencia CF 59,853 Panathinaikósz 56,633 Ajax 54,826 Steaua București 53,781 2. kalapCsapat Koeff. Fenerbahçe 52,445 FC Basel 51,050 Lille OSC 47,033 Celtic 40,575 Everton 35,899 Club Brugge 34,065 Heerenveen 33,826 Galatasaray 33,445 Anderlecht 32,065 Austria Wien 31,565 FC København 26,890 Lazio 26,582 3. kalapCsapat Koeff. Hertha BSC 26,339 Sparta Praha 26,150 Dinamo Bucureşti 25,781 AÉK 25,633 Slavia Praha25,150 Levszki Szofija 24,250 Athletic Club 23,853 Partizan 23,050 Hapóél Tel-Aviv 18,050 Twente 17,826 Dinamo Zagreb 16,466 Fulham 15,899 4. kalapCsapat Koeff. CSZKA Szofija 14,250 Toulouse 14,033 CFR Cluj 13,781 Genoa 12,582 Rapid Wien 8,565 FC Timişoara 7,781 BATE Bariszav 7,733 Nacional 7,292 Red Bull Salzburg 6,565 Sturm Graz 3,565 Ventspils 2,832 Sheriff Tiraspol 1,333 CV Címvédő
Mérkőzések Sorrend meghatározása Az UEFA versenyszabályzatának 7.05 pontja alapján, ha két vagy több csapat a csoportmérkőzések után azonos pontszámmal állt, az alábbiak alapján kellett meghatározni a sorrendet: az azonosan álló csapatok mérkőzésein szerzett több pont az azonosan álló csapatok mérkőzésein elért jobb gólkülönbség az azonosan álló csapatok mérkőzésein idegenben szerzett több gól az összes mérkőzésen elért jobb gólkülönbség az összes mérkőzésen szerzett több gól az azonosan álló csapatok és nemzeti szövetségük jobb UEFA-együtthatója az elmúlt öt évben
SzínmagyarázatA csoportok első két helyezettje bejutott az egyenes kieséses szakaszba.A csoportok harmadik és negyedik helyezettjeinek véget ért a nemzetközi kupaszereplés.
Minden időpont CET/CEST szerint van feltüntetve.
A csoport Csapat1
1 A Dinamo Zagreb csapatának két hazai mérkőzését zárt kapuk mögött kellett rendeznie, valamint az UEFA a csapat eredményéből 3 pontot levont. A Dinamo Zagreb fellebbezett, az UEFA visszaadta az elvett három pontot, de a klubot 75 000 eurós pénzbüntetéssel sújtotta, valamint eltiltották az UEFA kupasorozataiból. Utóbbi ítéletet három évre felfüggesztették.
B csoport Csapat
C csoport Csapat
1 A Rapid Wien hazai mérkőzéseit az Ernst Happel Stadionban játszotta, mert nagyobb befogadóképességű, mint a Gerhard Hanappi Stadion.
D csoport Csapat
2 A Ventspils otthoni mérkőzéseit a rigai Skonto stadionban játszotta, mert a ventspilsi Olimpiai Stadion nem felelt meg az UEFA követelményeinek.
E csoport Csapat
3 CSZKA Szofija az otthoni mérkőzéseit a Vaszil Levszki Nemzeti Stadionban játszotta, mert a Balgarszka Armija Stadion nem felelt meg az UEFA követelményeinek.
F csoport Csapat
5 A Dinamo Bucureştinek két mérkőzést zárt kapuk mögött kellett játszania a Slovan Liberec elleni mértkőzésen történt rendbontás miatt.
G csoport Csapat
H csoport Csapat
6 A Steaua Bucureștinek két hazai meccsét zárt kapuk mögött kellett játszania az Újpest elleni mérkőzésen történt rendbontásért.
I csoport Csapat
7 A BATE Bariszav otthoni mérkőzéseit a minszki Dinama Stadionban játszotta, mert a bariszavi Haradszki Stadion nem felel meg az UEFA követelményeinek.
J csoport Csapat
K csoport Csapat
L csoport Csapat
Jegyzetek
csoportkör