I rettori dell'Università di Lipsia vengono nominati ogni semestre. Il semestre estivo (in seguito denominato SS) ha inizio il 23 aprile e il semestre invernale (di seguito denominato WS) intorno al 16 ottobre. La scelta del rettore era dall'inizio del Medioevo all'era moderna e dipendeva dalla sua affiliazione con le facoltà. Quando un rettore muore durante il suo mandato, viene sostituito da un rappresentante. Dal 1831, i rettori si avvicendano ogni anno, e dal tempo del nazionalsocialismo i rettori hanno avuto diversi anni di ufficio. Dal 5 maggio 1953 al febbraio 1991, l'Università di Lipsia fu denominata "Università Karl Marx di Lipsia".

XV secolo

1409–1419 Nr.NomeAnnoSemestre1Johannes Otto von Münsterberg1409WS2Helmhold Glaedenstedt1410SS3Vinzent Grüner1410WS4Burchard Tüntzmann1411SS5Laurentius von Heilsberg1411WS6Jakob Rodewitz1412SS7Henning Boltenhagen1412WS8Johann Hoffmann von Schweidnitz1413SS9Petrus Storch1413WS10Petrus Wegun1414SS11Hermann Daum1414WS12Johannes Zach1415SS13Nikolaus Hüter1415WS14Lubbertus Starten1416SS15Helmhold Glaedenstedt1416WS16Matthias von Haynau1417SS17Hermann von Torgau1417WS18Johannes Hamme1418SS19Johannes de Hallen1418WS20Günther von Wiesa1419SS21Jakob Rodewitz1419WS

1420–1439 Nr.NomeAnnoSemestre22Henning von Hildesheim1420SS23Andreas von Weissenstadt1420WS24Nikolaus von Liegnitz1421SS25Johannes Löbeke1421WS26Johannes Schipmann1422SS27Volquin von Aachen1422WS28Timotheus von Mergenow1423SS29Georg Nebildaw1423WS30Nikolaus Schulteti1424SS31Johannes Weicker1424WS32Andreas von Gersdorf1425SS33Michael von Cottbus1425WS34Conrad Donekorff1426SS35Friedrich Smydel1426WS36Nikolaus Weigel1427SS37Augustin Bürnchin1427WS38Hermann Wulko1428SS39Johannes Törtsch1428WS40Johannes Zach1429SS41Johannes Grosse1429WS42Johannes Landschreiber1430SS43Jakob Meseberg1430WS44Johannes Tornow1431SS45Bernhard Rosenau1431WS46Rucker von Lauterburg1432SS47Arnold Westphal1432WS48Stephan Hüfner1433SS49Andreas Ruperti1433WS50Burchard Plotze1434SS51Heinrich Imhof1434WS52Martin Spremberg1435SS53Peter Pirner1435WS54Arnold Westphal1436SS55Heinrich Lür1436WS56Johannes Ermelreich1437SS57Johannes Wünschelburg1437WS58Christopf von Stockholm1438SS59Hermann von Heldburg1438WS60Dietrich von Bocksdorf1439SS61Jacob Schulteti1439WS

1440–1459 Nr.NomeAnnoSemestre62Johannes Weicker1440SS63Johannes von Brieg1440WSaus Brieg64Johannes Schimmelpfennig1441SS65Nikolaus Garden1441WS66Pelegrin von Goch1442SS67Kasper Weigel1442WS68Johannes Wiese1443SS69Johannes von Weida1443WS70Heinrich Steinbach1444SS71Johannes Schwoffheim1444WS72Johannes Salista1445SS73Konrad Thüne1445WS74Konrad Deinhard1446SS75Franz Kurtz (Rektor)1446WS76Johannes Swisiko1447SS77Peter Prischwitz1447WS78Johannes Breitrucke1448SS79Andreas Wagner (Rektor)1448WS80Heinrich Kohlhoff1449SS81Nikolaus Tronitz1449WS82Johannes Murmann1450SS83Georg Steinbrecher1450WS84Peter Manschein1451SS85Andreas Rudiger1451WS86Johannes Heberer1452SS87Johannes Bresslauer1452WS88Nikolaus Smilow1453SS89Thimo Passer1453WS90Konrad Flurherr1454SS91Nikolaus Gerstmann1454WS92Heinrich Elling1455SS93Peter Seehausen1455WS94Johannes Schwertmann1456SS95Nikolaus Meltzer1456WS96Hermann Steinberg1457SS97Johannes Taymuth1457WS98Johannes Scheurelin1458SS99Christoph Thyme1458WS100Heinrich Kolk1459SS101Johannes Gedaw1459WS

1460–1479 Nr.NameAnnoSemestre102Heinrich Pernold1460SS103Christoph Thyme1460WS104Heinrich Kolk1461SS105Johannes Meise gen. Eutritzsch1461WS106Johannes Stublinger1462SS107Hieronymus Schwoffheim1462WS108Johannes Evernhusen1463SS109Dionxsius Flegk1463WS110Johannes Fabri1464SS111Thomas Werner1464WS112Johannes Hasenfelt1465SS113Dietrich von Schönberg1465WS114Johannes Heroit1466SS115Thomas Hertel1466WS116Thomas Laram1467SS117Stephan Fortune1467WS118Johannes Permeter1468SS119Stanislaus Poehmann1468WS120Richard Karstens1469SS121Nicolaus Grobitzsch1469WS122Johannes Spiess1470SS123Johannes Fabri (Krossen)1470WS124Christian von Dietmarschen1471SS125Nikolaus Ghyr1471WS126Johannes Fabri (Forchheim)1472SS127Christoph Thyme1472WS128Andreas Dehne1473SS129Leonhard Meseberg1473WS130Johannes Tolhopf1474SS131Johannes Kleine1474WS132Adolf II. von Anhalt-Köthen1475SS133Peter Hofmann1475WS134Lambert von dem Hoeff1476SS135Georg Voigt1476WS136Johannes Lintz1477SS137Christoph Eckel1477WS138Johannes von Rothenburg1478SS139Johannes Wilhelmi1478WS140Johannes Lireke1479SS141Johannes Herold1479WS

1480–1499 Nr.NomeAnnoSemestre142Johannes Kappentanz1480SS143Martin Fuhrmann1480WS144Jakob Gißlonis1481SS145Johannes Thümmel1481WS146Andreas Frisner1482SS147Martin Furmann1482WS148Peter Herren1483SS149Johannes Burborger1483WS150Bartholomäus Hammer1484SS151Christoph Bircke1484WS152Heinrich Greffe1485SS153Georg Weßennigk1485WS154Johannes Fabri (Donauwörth)1486SS155Georg Lessener1486WS156Erich von Schweden1487SS157Leonhard Pölner1487WS158Nicolaus Schreiter1488SS159Wenzeslaus Fabri1488SS160Mattheus Damerow1489WS161Johannes Reinhart1489SS162Heinrich Kolk1490WS163Melchior Ludwig1490SS164Martin Sporn1491WS165Wenzeslaus Judicis1491SS166Nikolaus Kleinschmidt1492WS167Christoph Tömrich1492SS168Pascha Alvesleben1493WS169Nikolaus Heiner1493SS170Konrad Wimpina1494WS171Matthias Frauendienst1494SS172Johannes Ruloff1495WS173Bernhard Thumirnicht1495SS174Georg Pertoltzfelder1496WS175Jodocus Bretzner1496SS176Johannes Bruckow1497WS177Johannes Peylick1497SS178Jodocus Engerer1498WS179Nikolaus Zeler1498SS180Magnus Hundt1499WS181Johannes Hennigk1499SS

XVI secolo

1500–1519 Nr.NomeAnnoSemestre182Georg Dottanius1500SS183Nikolaus Fabri (Grünberg)1500WS184Sebastian Zimmermann1501SS185Brandanus von Schöneich1501WS186Virgel Wellendorfer1502SS187Johannes Honorius1502WS188Peter Eisenberg1503SS189Michael Rau1503WS190Sigesmund Altmann1504SS191Stephan Gert1504WS192Heinrich Raleveshusen1505SS193Matthaeus Hennigk1505WS194Sixtus Pfeffer1506SS195Martin Meyendorn1506WS196Arnold Wöstefeldes1507SS197Ludwig Sartoris1507WS198Heinrich Stromer1508SS199Gregor Breitkopf1508WS200Thilo von Trotha1509SS201Paul Schwoffheim1509WS202Hieronymus Dungersheim1510SS203Peter Wirth (Löwenberg)1510WS204Johannes Sperber1511SS205Paul Schiller1511WS206Konrad Tockler1512SS207Sebastian von der Heide1512WS208Godehard Lüderi1513SS209Andreas Propst1513WS210Nikolaus Apel1514SS211Wolfgang Schindler1514WS212Johannes Rogge1515SS213Johannes Koel1515WS214Alexander Sockler1516SS215Johannes Langer1516WS216Paul Dhym1517SS217Franz Richter (Hainichen)1517WS218Simon Eissemann1518SS219Johannes Lange1518WS220Arnold Wöstenfeldes1519SS221Andreas Probst1519WS

1520–1539 Nr.NomeAnnoSemestre222Petrus Mosellanus1520SS223Christoph Hegendorf1520WS224Paul Dhym1521SS225Heinrich Eberhausen1521WS226Nikolaus Apel1522SS227Andreas Franck1522WS228Petrus Mosellanus1523SS229Christoph Hegendorf1523WS230Johannes Reusch1524SS231Paul Schwoffheim1524WS232Henning Pyrgallus1525SS233Casper Barth1525WS234Paul Fetzer1526SS235Johannes Weiss1526WS236Johannes Steinhoff1527SS237Petrus Scorler1527WS238Johannes Sauer1528SS239Ludwig Sartoris1528WS240Georg von Soda1529SS241Johannes Pfeil1529WS242Johannes Musler1530SS243Martin Titz1530WS244Johannes Stramburg1531SS245Johannes Fritzsch1531WS246Gottfried Sybott1532SS247Petrus Brockendorf1532WS248Arnold Wöstenfels1533SS249Paul Lobwasser1533WS250Friedrich Peypus1534SS251Valerius Pfister1534WS252Heinrich Gottschalk1535SS253Erhard Neupar1535WS254Ulrich Steudler1536SS255Christoph Montag1536WS256Christian Pistorius1537SS257Leonhard Badehorn1537WS258Gottfried Sybott1538SS259Christoph Montag1538WS260Christian Pistorius1539SS261Caspar Borner1539WS

1540–1559 Nr.NomeAnnoSemestre262Ulrich Steudler1540SS263Georg Czeler1540WS264Henning Pyrgallus1541SS265Caspar Borner1541WS266Johannes Sauer1542SS267Christoph Watzek1542WS268Paul Bussinus1543SS269Caspar Borner1543WS270Joachim Camerarius der Ältere1544SS271Georg Czeler1544WS272Joachim von Kneitlingen1545SS273Leonhard Badehorn1545WS274Joachim Camerarius der Ältere1546SS275Konstantin Pflügler1546WS276Paul Bussinus1547SS277Wolfgang Meurer1547WS278Johannes Sinappius1548SS279Donatus Zöllner1548WS280Joachim von Kneitlingen1549SS281Blasius Thammüller1549WS282Heinrich Salmuth1550SS283Peter Thomäus1550WS284Heinrich Cordes1551SS285Caspar Landsidel1551WS286Johannes Hommel1552SS287Georg Czeler1552WS288Bartolus Richius auch Reiche1553SS289Maximus Geritz1553WS290Johannes Meyer (Seligenstadt)1554SS291Franz Kram1554WS292Alexander Alesius1555SS293Aegidius Morch1555WS294Andreas Knauer1556SS295Siegesmund Prüfer1556WS296Ernst Bock1557SS297Hieronymus Zynaus1557WS298Joachim Camerarius der Ältere1558SS299Andreas Freyhub1558WS300Anton Glining1559SS301Peter Helborn1559WS

1560–1579 Nr.NomeAnnoSemestre302Johannes Hommel1560SS303Franz Kram1560WS304Alexander Alesius1561SS305Andreas Morch1561WS306Leonhard Wolf oder Leonhard Lycius1562SS307Andreas Freyhub1562WS308Caspar Jungerman1563SS309Andreas Ellinger1563WS310Victorin Strigel1564SS311Franz Kram1564WS312Georg Costius oder Georg Kest1565SS313Simon Scheibe1565WS314Georg Masbach1566SS315Balthasar Gütler1566WS316Johann Cramer1567SS317Maximus Geritz1567WS318Leonhard Wolf oder Leonhard Lycius1568SS319Erasmus Kirstein1568WS320Anton Glining1569SS321Simon Scheibe1569WS322Johann Stromer1570SS323Andreas Freyhub1570WS324Caspar Jungerman1571SS325Amandus Pfister1571WS326Georg Masbach1572SS327Balthasar Gütler1572WS328Georg Costius1573SS329Zacharias Schilter1573WS330Georg Masbach1574SS331Michael Wirth1574WS332Caspar Jungerman1575SS333Michael Barth157WS334Johann Albinus oder Johann Weiss1576SS335Michael Mascus1576WS336Anton Glining1577SS337Zacharias Schilter1577WS338Andreas Scheffer1578SS339Michael Wirth1578WS340Caspar Jungerman1579SS341Simon Scheibe1579WS

1580–1599 Nr.NomeAnnoSemestre342Johann Albinus1580SS343Jacob Blümel1580WS344Caspar Jungerman1581SS345Balthasar Schelhammer1581WS346Andreas Scheffer1582SS347Michael Mascus1582WS348Johannes Cramer1583SS349Michael Barth1583WS350Johann Albinus1584SS351Jacob Blümel1584WS352Franz Romanus (1550–1636)1585SS353Abraham Fabri1585WS354Andreas Scheffer1586SS355Hieronymus Günther1586WS356Caspar Jungerman1587SS357Sigismund Badehorn1587WS358Johann Albinus1588SS359Balthasar Gütler1588WS360Georg Walther1589SS361Zacharias Schilter1589WS362Johannes Oettwein1590SS363Burchard Harbart1590WS364Casper Jungerman1591SS365Christoph Meurer1591WS366Andreas Hommel1592SS367Michael Wirth1592WS368Joachim Tancke1593SS369Johann Münch1593WS370Johann Albinus1594SS371Johannes Neldel1594WS372Ulrich von Norwegen Sohn von Christian IV. (Dänemark und Norwegen) Prorektor Franz Romanus (1550–1636)1595SS373Elias Heidenreich1595WS374Johannes Friderich1596SS375Jacob Blümel1596WS376Johannes Curtius1597SS377Bartholomäus Gölnitz1597WS378Wolfgang Corvinus auch Wolfgang Rabe1598SS379Balthasar Gütler1598WS380Joachim Tanck (Rektor)1599SS381Matthäus Dresser1599WS

XVII secolo

1600–1619 Nr.NomeAnnoSemestre382Andreas Doerer1600SS383Georg Weinrich1600WS384Franz Romanus1601SS385Johannes Mayer1601WS386Philipp Julius von Pommern Prorektor Johann Andreas Hommel1602SS387Burchard Harbart1602WS388Johannes Curtius1603SS389Zacharias Schilter1603WS390Johannes Friderich1604SS391Adolf Friedrich von Mecklenburg Prorektor Michael Wirth1604WS392Gabriel Tincelius1605SS393Wolfgang Mayer1605WS394Wilhelm Schmuck1606SS395Andreas Emmenius1606WS396Franz Romanus1607SS397Christoph Bruno1607WS398Wolfgang Corvinus oder Wolfgang Rabe1608SS399Georg Feige1608WS400Otto Schwalenberg1609SS401Christoph Meurer1609WS402Johannes Leonhard Agricola1610SS403Johannes Neldel1610WS404Konrad Bavarus1611SS405Bartholomaeus Gölnitz1611WS406Wilhelm Schmuck1612SS407Johann Philipp von Sachsen-Altenburg Prorektor Michael Wirth1612WS408Johann Philipp von Sachsen-Altenburg Prorektor Leopold Hackelmann1613SS409Johann Philipp von Sachsen-Altenburg Christoph Bruno1613WS410Johann Philipp von Sachsen-Altenburg