Gli MTV Europe Music Awards 2006 sono stati trasmessi il 2 novembre 2006 simultaneamente al Bella Center e Rådhuspladsen in Copenaghen, Danimarca. Questa fu la 13 edizione degli MTV Europe Music Awards e fu presentata dal cantante Justin Timberlake.
Premi I vincitori della categoria sono evidenziati in grassetto.
Miglior gruppo Black Eyed Peas Red Hot Chili Peppers The Pussycat Dolls Keane Depeche Mode
Miglior canzone "Hips Don't Lie", Shakira featuring Wyclef Jean "SOS", Rihanna "Crazy", Gnarls Barkley "Maneater", Nelly Furtado "Dani California", Red Hot Chili Peppers
Miglior artista femminile Madonna Shakira Beyoncé Christina Aguilera Nelly Furtado
Miglior R&B Beyoncé Mary J. Blige OutKast Rihanna Pharrell Williams
Miglior album Confessions on a Dance Floor, Madonna Stadium Arcadium, Red Hot Chili Peppers Back to Basics, Christina Aguilera Loose, Nelly Furtado Black Holes & Revelations, Muse
Miglior artista Alternative System of a Down Arctic Monkeys Muse The Raconteurs KoЯn
Miglior artista Rock Red Hot Chili Peppers Evanescence The Killers Keane The Strokes
Miglior artista Pop Madonna Christina Aguilera Shakira Robbie Williams Justin Timberlake
Miglior video A Million Ways, OK Go Crazy, Gnarls Barkley We Are Your Friends, Justice vs. Simian Stupid Girls, Pink (cantante) Touch the Sky, Kanye West
Miglior artista maschile Justin Timberlake Kanye West Pharrell Williams Robbie Williams Sean Paul
Miglior artista emergente I vincitori non sono stati decretati dai telespettatori di MTV ma dalle celebrità in persona. Gnarls Barkley Altri nominati nella categoria: Panic! at the Disco Ne-Yo Fall Out Boy Lily Allen We Are Scientists Arctic Monkeys Lordi
Premi regionali Miglior artista adriatico Aleksandra Kovač Edo Maajka Let 3 Neisha Siddharta
Miglior artista africano Freshlyground Nameless P-Square Juma Nature Anselmo Ralph
Miglior artista baltico Brainstorm Vanilla Ninja Skamp Inculto Tanel Padar & the Sun
Miglior artista danese Kashmir Outlandish Nik & Jay L.O.C. Spleen United
Miglior artista olandese & belga Anouk dEUS Gabriel Rios Pete Philly Kane
Miglior artista finlandese Poets of the Fall Lordi Von Hertzen Brothers Olavi Uusivirta PMMP
Miglior artista francese Diam's Bob Sinclar Rohff Olivia Ruiz 113
Miglior artista tedesco Bushido Die Toten Hosen Rammstein Silbermond Sportfreunde Stiller
Miglior artista italiano
Jovanotti Lacuna Coil Finley Mondo Marcio Tiziano Ferro
Miglior artista norvegese Elvira Nikolaisen Serena Maneesh Mira Craig Amulet Marit Larsen
Miglior artista polacco Virgin Coma Blog 27 Hey SiStars
Miglior artista portoghese Boss AC David Fonseca Expensive Soul Mind Da Gap Moonspell
Miglior artista rumeno DJ Project Blondy Morandi Paraziții Simplu
Miglior artista russo Dima Bilan t.A.T.u. Valerij Meladze Gorod 312 Uma2rman
Miglior artista spagnolo La Oreja de van Gogh Pereza [a Excepción Macaco Nena Daconte
Miglior artista svedese Lisa Miskovsky Snook The Sounds The Knife Peter Bjorn and John
Miglior artista UK & Irlanda
Arctic Monkeys Corinne Bailey Rae Lily Allen Muse The Kooks
Esibizioni Justin Timberlake — SexyBack / My Love / LoveStoned Nelly Furtado — Maneater Muse — Starlight The Killers — When You Were Young Keane — Is It Any Wonder? P. Diddy (featuring Cassie) — Come to Me Rihanna — SOS Snoop Dogg (featuring Pharrell Williams) — Drop It like It's Hot Outlandish — I'm Callin' You Jet — Rip It Up Lordi — Hard Rock Hallelujah
Altri interventi Moby Sugababes Robbie Williams Lordi Daniel Craig Mads Mikkelsen Cassie Johnny Knoxville e Jeff Tremaine Borat Adrien Brody Timbaland Tiziano Ferro Kelis Kanye West China Moses
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