Biografia Nato in un villaggio dello Schleswig-Holstein, trascorse l'infanzia e la giovinezza ad Amburgo, dove apprese la musica sotto la guida di Thomas Selle e Heinrich Scheidemann. Si trasferì in gioventù a Lipsia, e si laureò in giurisprudenza all'università di Lipsia; rimase tutta la vita a Lipsia, svolgendo contemporaneamente l'attività di avvocato e quella di musicista. Divenne organista alla chiesa di San Nicola (Nikolaikirche) nel 1656, Kantor alla chiesa di San Paolo (Paulinerkirche) nel 1658 e primo direttore musicale dell'università di Lipsia, incarichi che conservò tutti fino alla morte.
Werner Fabricius compose musica sacra e musica profana, sia strumentale (suite, allemande, ecc.) che vocale (cantate). Scrisse anche un trattato sulle procedure per il collaudo degli organi che fu pubblicato postumo nel 1756.
Opere Le sue opere furono pubblicate in tre antologie: Deliciae harmonicae, contenenti arie di danza (allemande, correnti, ecc.) a cinque parti (1656) Lieder spirituali di E. C. Homburgs prima parte per voce e basso continuo (1659) Arie spirituali, dialoghi e concerti
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