Atopobium Collins and Wallbanks, 1993 è un genere di batteri appartenente agli Actinobacteria, della famiglia dei Coriobacteriaceae.
Le specie di Atopobium sono batteri anaerobici facoltativi, cocchi Gram-positivi di forma ellittica o a bastoncello che si trovano come elementi singoli o in coppia o in corte catene.
Atopobium vaginae è stato scoperto da Rodriguez Rodriguez Jovita M, Collins MD, Sjödén B, Falsen E. Characterization of a novel Atopobium isolate from the human vagina: description of Atopobium vaginae sp. nov. Int J Syst Bacteriol. 1999 Oct;49 Pt 4:1573-6. PubMed PMID 10555338. nel 1999 ed è un comunemente presente nella vagina della donna con vaginosi batterica.
Questo è un batterio anaerobo facoltativo, Gram-positivo che non si riesce ad isolare con la microbiologia classica Verhelst R, Verstraelen H, Claeys G, Verschraegen G, Delanghe J, Van Simaey L, De Ganck C, Temmerman M, Vaneechoutte M. Cloning of 16S rRNA genes amplified from normal and disturbed vaginal microflora suggests a strong association between Atopobium vaginae, Gardnerella vaginalis and bacterial vaginosis. BMC Microbiol. 2004 Apr 21;4:16. PMID 15102329; è presente in corso di vaginosi batterica secondo Burton nel 50% dei casi Burton JP, Devillard E, Cadieux PA, Hammond JA, Reid G. Detection of Atopobium vaginae in postmenopausal women by cultivation-independent methods warrants further investigation. J Clin Microbiol 2004; 42: 1829-1831.PMID 15071062Burton JP, Chilcott CN, Al-Qumber M, Brooks HJ, Wilson D, Tagg JR, Devenish C. A preliminary survey of Atopobium vaginae in women attending the Dunedin gynaecology out-patients clinic: is the contribution of the hard-to-culture microbiota overlooked in gynaecological disorders? Aust N Z J Obstet Gynaecol. 2005 Oct;45(5):450-2. PMID 16171487.; secondo Ferris M. J. Ferris, et al., Use of Species-Directed 16S rRNA Gene PCR Primers for Detection of Atopobium vaginae in Patients with Bacterial Vaginosis. JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY, Dec. 2004, p. 5892–5894 Vol. 42, No. 12 PMID è presente fino al 70 % in corso di vaginosi batterica.
Specie Il Genere Atopobium è costituito dalle seguenti specie:Collins & Wallbanks, 1993
Atopobium fossor (Bailey & Love, 1986)Kageyama A, Benno Y, Nakase T. Phylogenic and phenotypic evidence for the transfer of Eubacterium fossor to the genus Atopobium as Atopobium fossor comb. nov. Microbiol Immunol. 1999;43(5):389-95. PubMed PMID 10449244.
Atopobium minutum (Hauduroy et al., 1937)Altonsy MO, Andrews SC, Tuohy KM. Differential induction of apoptosis in human colonic carcinoma cells (Caco-2) by Atopobium, and commensal, probiotic and enteropathogenic bacteria: mediation by the mitochondrial pathway. Int J Food Microbiol. 2010 Feb 28;137(2-3):190-203. Epub 2009 Dec 5. PubMed PMID 20036023.Lau SK, McNabb A, Woo GK, Hoang L, Fung AM, Chung LM, Woo PC, Yuen KY.Catabacter hongkongensis gen. nov., sp. nov., isolated from blood cultures of patients from Hong Kong and Canada. J Clin Microbiol. 2007 Feb;45(2):395-401.Epub 2006 Nov 22. PubMed PMID 17122022;Eschenlauer SC, McKain N, Walker ND, McEwan NR, Newbold CJ, Wallace RJ.Ammonia production by ruminal microorganisms and enumeration, isolation, and characterization of bacteria capable of growth on peptides and amino acids from the sheep rumen. Appl Environ Microbiol. 2002 Oct;68(10):4925-31. PubMed PMID 12324340;Jousimies-Somer H. Recently described clinically important anaerobic bacteria: taxonomic aspects and update. Clin Infect Dis. 1997 Sep;25 Suppl 2:S78-87. Review. PubMed PMID 9310640. Atopobium parvulum (Weinberg et al., 1937) Collins & Wallbanks, 1993 isolato nel cavo orale, è causa di alitosi e periodontiti Riggio MP, Lennon A, Rolph HJ, Hodge PJ, Donaldson A, Maxwell AJ, Bagg J. Molecular identification of bacteria on the tongue dorsum of subjects with and without halitosis. Oral Dis. 2008 Apr;14(3):251-8. PubMed PMID 18336372.Kumar PS, Griffen AL, Barton JA, Paster BJ, Moeschberger ML, Leys EJ. New bacterial species associated with chronic periodontitis. J Dent Res. 2003 May;82(5):338-44. PubMed PMID 12709498.Kazor CE, Mitchell PM, Lee AM, Stokes LN, Loesche WJ, Dewhirst FE, Paster BJ. Diversity of bacterial populations on the tongue dorsa of patients with halitosis and healthy patients. J Clin Microbiol. 2003 Feb;41(2):558-63. PubMed PMID 12574246.Downes J, Munson MA, Spratt DA, Kononen E, Tarkka E, Jousimies-Somer H, Wade WG. Characterisation of Eubacterium-like strains isolated from oral infections. J Med Microbiol. 2001 Nov;50(11):947-51. PubMed PMID 11699590.
Atopobium rimae (Olsen et al., 1991) Collins & Wallbanks, 1993 isolato in un caso di batteriemia da cirrosi epatica Chung HY, Sung H, Lee MY, Yoon NS, Lee SG, Suh DJ, Kim MN. [A case of bacteremia by Atopobium rimae in a patient with liver cirrhosis]. Korean J Lab Med. 2007 Oct;27(5):351-4. Korean. PubMed PMID 18094600. e in periodontiti del cavo orale
Atopobium vaginae Rodriguez Jovita et al., 1999 isolato nella vagina e nel tratto urinario dell'uomo
Batteriologia Il genere Atopobium fu proposto per la prima volta nel 1992. LAtopobium vaginae è stato isolato dalla flora vaginale di persone sane e non. Esso è un batterio anaerobo facoltativo, Gram-positivo a forma di cocco ellittico o bastoncello, che forma piccole colonie su agar sangue a 37 °C, misura approssimativamente 0,6-0.9 mcm; positivo alla fosfatasi acida ed è indolo-negativo. Non produce acido dal metabolismo del mannosio e del raffinosio ed ha una debole attività per gli enzimi:
fenilalanina arilamidasi a-arabinoside, cistina arilamidasi, chimotripsina, lipasi-esterasica C8, esterasi C4, alfa-fucosidasi, alfa-galactosidasi,* beta-galattosidasi, beta-galattosidasi 6-fosfato, acido glutamico decarbossilasi, acido glutamilglutamico, acido arilamidasi, beta-glucuronidasi, alfa-mannosidasi, beta-N-acetilglucosaminidasi, lipasi C 14, acido piroglutamico arilamidasi, tirosina arilamidase
gli enzimi tripsina o l'ureasi non sono rintracciati. Non è in grado di ridurre il nitrato e di idrolizzare la legatina e l'esculina . Il ceppo tipo (usato per le ricerche microbiologiche) è il CCUG 38953T .
LAtopobium vaginae rispetto al genere Atopobium ha approssimativamente un range di divergenza dell'16s rRNA del 3-8% Collins, M. D. 81 Wallbanks, S. (1992). Comparative sequence analysis of the 16s rRNA genes of Lactobacillus minutus, Lactobacillus rimae and Streptococcus parvulus: proposal for the creation of a new genus Atopobium. FEMS Microbiol Lett 95, 235-240. PMIDStackebrandt, E. & Ludwig, W. (1994). The importance of using outgroup reference organisms in phylogenetic studies: the Atopobium case. Syst Appl Microbioll7, 3943. PMID; divergenza genetica che ha permesso di riconoscerlo come una nuova specie .
Biochimica differenziale del genere Atopobium Secondo Rodriguez, in base all'attività enzimatica, possono essere distinte le seguenti speci di Atopobium:Mar Rodriguez Jovita, Matthew D. Collins, Berit Sjoden and Enevold FaIsen. Characterization of a novel Atopobium isolate from the human vagina: description of Atopobium vaginae sp. nov. International Journal of Systematic Bacteriology (1999), 49, 1573-1576. PMID
Diversità enzimatiche comparate tra le varie specie di Atopobium EnzimaA. vaginaeA. minutumA. parvulumA. rimaeFosfatasi acida+-++Alanina arilamidasi--+-Arginina diidrolasi++--Arginina arilamidasi+++-Istidina arilamidasi+---beta-Galactosidasi--+-Leucina arilamidasi+-+-Prolina arilamidasi++--Ac. piroglutamico arilamidasi-v++Glicina arilamidasi+-+-Serina arilamidasi+---Tirosina arilamidasi--+- Legenda +, l'espressione dell'enzima è costitutiva -, l'enzima è assente e non inducibile v, l'espressione dell'enzima è variabile
Storia Il genere Atopobium fu proposto per la prima volta nel 1992 , a questo genere appartenevano batteri isolati, precedentemente classificati come Lactobacillus minitus, L. Rimae e Streptococcus parvulus. Il primo isolamento dell'Atopobium vaginae da materiale vaginale si deve a Rodriguez e coll. dellDepartment of Microbiology, BBSRC Institute of Food Research, Reading, UK. nel 1999, che grazie a tecniche di sequenziamento del RNA-ribosomiale 16S, individuarono per primi una nuova specie appartenente al genere Atopobium GenBank reference No. AF325325.
L'aspetto di questo batterio alla colorazione di Gram è quello di un piccolo cocco Gram-positivo anaerobo facoltativo. I membri del genere sono noti per produrre grandi quantità di acido lattico per questo motivo alcune specie appartenenti al genere Atopobium sono stati inizialmente identificati come Lactobacillus sp. Fu, infatti, nel corso di uno studio di lattobacilli vaginali che l'A. vaginae fu identificato (Rodriguez 1999).
Epidemiologia Studi condotti su donne adulte con normale flora vaginale hanno riportato che la prevalenza dell'A. vaginae determinata con la PCR oscilla tra l'8% e il 20% in donne asintomatiche; mentre le donne che hanno una vaginosi batterica in atto le percentuali di ritrovamento sono comprese tra il 54% e il 78% Ferris MJ, Masztal A, Aldridge KE. Association of Atopobium vaginae, a recently described metronidazole resistant anaerobe, with bacterial vaginosis. BMC Infect Dis 2004; 4:5. PMID Verhelst R, Verstraelen H, Claeys G, et al. Cloning of 16S rRNA genes amplified from normal and disturbed vaginal microflora suggests a strong association between Atopobium vaginae, Gardnerella vaginalis and bacterial vaginosis. BMC Microbiol 2004; 4:16. PMID.
Clinica
Collins e Wallbanks nel 1992 hanno proposto di rinominare la specie Lactobacillus minutus, Lactobacillus Rimaee, Streptococcus parvulus e Atopobium Rimae. LAtopobium parvulum e Atopobium minutum sono stati isolati nell'uomo nelle tasche gengivali e in varie infezioni umane (ad esempio, in odontoiatria o in ascessi pelvici o ferite addominali), Ma il significato clinico delle specie di Atopobium spp non è stato chiaramente definito fino ad oggi. Ciò potrebbe essere dovuto al fatto che questi batteri non sono ancora inclusi nei sistemi di indagine batterica disponibili in commercio e, pertanto, sono suscettibili di essere erroneamente identificati come Lactobacillus o Streptococco specie in base alle caratteristiche morfologiche delle loro colonie.
LAtopobium vaginae è del genere Atopobium la specie più studiata isolata per la prima volta nel 1999, un aspetto rilevante di questo batterio e che esso difficilmente si rileva in materiale vaginale di donne sane per vaginosi batterica, mentre è presente nel 50% o più nelle secrezioni vaginali di donne con vaginosi batterica Ferris MJ, Un Masztal, Aldridge KE, Fortenberry JD, Fidel Jr PL, Martin DH. Association of Atopobium vaginae, a recently described metronidazole resistant anaerobe, with bacterial vaginosis. BMC Infect Dis. 13 feb. 2004; 04:05. PMID 15018635.
Inoltre, il batterio presenta una costante resistenza batterica all'antibiotico metronidazolo che è l'antibiotico più usato in caso di vaginosi batterica.
Nel 2003 l'''Atopobium vaginae per la prima volta è stato messo in relazione con un caso patologico: un ascesso tubovarico seguito ad un prelievo di oocita per via trans-transvaginale Geissdörfer W, Böhmer C, Pelz K, Schoerner C, Frobenius W, Bogdan C. Tuboovarian abscess caused by Atopobium vaginae following transvaginal oocyte recovery. J Clin Microbiol. 2003 Jun;41(6):2788-90. PMID 12791933.
Nel lavoro di Burton del 2004 l'A. vaginae è stato isolato in donne in post menopausa, in assenza di alcuna sintomatologia, nel 44% dei prelievi vaginali effettuati.
LAtopobium vaginae sembra essere un normale saprofita della flora batterica della vagina sana (presumibilmente con una carica batterica bassa) ma può diventare predominante per un rapido accrescimento quando si verificano le condizioni per una diminuzione della normale flora lattobacillare; ed è rilevante la compresenza di questo batterio con il più noto Gardnerella vaginalis in corso di vaginosi batterica sintomatica .