Christophe Rochus non ha difeso il titolo conquistato l'anno precedente.
Il singolare del torneo di tennis Zagreb Open 2009, facente parte della categoria ATP Challenger Tour, ha avuto come vincitore Marcos Daniel che ha battuto in finale Olivier Rochus con il punteggio di 6–3, 6–4.
Teste di serie
Nicolas Devilder (semifinali) Robert Kendrick (secondo turno) Leonardo Mayer (primo turno) Brian Dabul (quarti di finale)
Roko Karanušić (quarti di finale) Thiago Alves (primo turno) Marcos Daniel (campione) Jiří Vaněk (primo turno)
Tabellone
Finali
Parte alta
Parte bassa
Note
Categoria:Zagreb Open 2009