Professionista dal 1980 al 1991, giunse secondo alla Vuelta a España 1981 e vinse la maglia verde, simbolo della classifica scalatori, al Giro d'Italia 1986. In entrambe le corse ottenne anche un successo di tappa.
Carriera Muñoz passò professionista nel 1980 con la Fosforera/Zor, distinguendosi come scalatore e vincendo una tappa montana della Vuelta a Asturias. L'anno seguente ottenne altre quattro vittorie tra cui un'altra tappa della corsa asturiana che concluderà sul terzo gradino del podio. Fu inoltre secondo nella Volta a la Comunitat Valenciana e nell'Escalada a Montjuich. Alla Vuelta a España fu secondo nella classifica generale a soli ventitré anni dietro a Giovanni Battaglin e vinse anche una tappa, la quindicesima.
Nel 1982 centrò un secondo posto nella Volta Ciclista a Catalunya, mentre deluse sia al Giro d'Italia che alla Vuelta. Vinse sei corse fra cui due tappe alla Setmana Catalana, oltre a salire ancora sul podio nell'Escalada a Montjuich ed anche nella classica Subida al Naranco. L'anno dopo vinse la Vuelta a Castilla e la Vuelta a Asturias e si classificò undicesimo al Giro d'Italia arrivando terzo nella speciale classifica degli scalatori. Nel 1984, appena passato alla Teka, puntò invece sul Tour de France, che concluse ottavo nella generale e secondo nella classifica dei giovani dietro a Greg LeMond, ottenendo inoltre diversi piazzamenti nei dieci nell'ultima settimana di corsa.
Nella stagione 1985 ottenne vittorie di tappa alla Parigi-Nizza (conclusa in quinta posizione) e alla Vuelta al País Vasco mentre non portò a termine né la Vuelta né il Tour. Nel 1986 arrivò decimo al Giro d'Italia, del quale vinse una tappa e anche la classifica degli scalatori, e si ritirò nuovamente al Tour. Nel biennio successivo non ottiene vittorie ma solo buoni piazzamenti in varie corse a tappe. Centrò la sua ultima vittoria in carriera nel 1989 imponendosi in una tappa alla Vuelta a Burgos per poi ritirarsi nel 1991 dopo un'ultima stagione incolore alla Artiach.
Palmarès
1980 6ª tappa Vuelta a Asturias
1981 15ª tappa Vuelta a España 3ª tappa Vuelta a Burgos 4ª tappa Setmana Catalana 6ª tappa Vuelta a Asturias
1982 Gran Premio de Navarra Classifica generale Volta a la Comunitat Valenciana 5ª tappa 2ª semitappa Vuelta a Aragón Prologo Setmana Catalana 2ª tappa 1ª semitappa Setmana Catalana Trofeo Masferrer
1983 Prologo Vuelta a Castilla Classifica generale Vuelta a Castilla 6ª tappa Vuelta a Asturias Classifica generale Vuelta a Asturias
1984 Prueba Villafranca de Ordizia 5ª tappa Volta Ciclista a Catalunya
1985 6ª tappa Parigi-Nizza 4ª tappa Vuelta al País Vasco
1986 16ª tappa Giro d'Italia 5ª tappa Parigi-Nizza
1989 5ª tappa Vuelta a Burgos
Altri successi 1986 Classifica GPM Giro d'Italia
Piazzamenti Grandi Giri
Giro d'Italia 1980: ritirato 1981: 41º 1982: ritirato 1983: 11º 1986: 10º 1987: 18º
Tour de France 1984: 8º 1985: ritirato 1986: ritirato 1987: 22º 1988: ritirato
Vuelta a España 1980: 27º 1981: 2º 1982: 25º 1983: 8º 1985: ritirato 1989: 34º
Classiche monumento
Liegi-Bastogne-Liegi 1985: 66º
Giro di Lombardia 1983: 17º
Competizioni mondiali Campionati del mondo Goodwood 1982 - In linea: 22º Barcellona 1984 - In linea: 26º
Collegamenti esterni