Fu professore presso l'Hôpital de la Charité di Parigi e nel 1827 subentrò a René Laennec (1781-1826) come presidente della facoltà di medicina clinica a Parigi.

Chomel era un importante membro del movimento di anatomia patologica dell'inizion del XIX secolo in Francia, che si basava sulla ricerca scientifica di Marie François Xavier Bichat (1771-1802), René Laennec e Gaspard Laurent Bayle (1774-1816). Nel 1828 ha fornito la prima descrizione di un tipo di polinevrite acuta che in seguito sarebbe stato conosciuto come sindrome di Guillain-Barré-Strohl. Il Dr. Worthington Hooker (1806-1867), nel suo libro, gli attribuisce il primo utilizzo contemporaneo dell'assioma medico: primum non nocere ("Primo, non nuocere").

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