Coeckebacker prese parte all'assedio del castello di Hara, durante la Rivolta di Shimabara, su richiesta del comandante in capo dell'esercito dello shogunato Nobutsuna Matsudaira, che chiese agli alleati olandesi di aiutarli a sconfiggere i ribelli cattolici, guidati dal rōnin Amakusa Shirō.
Coeckebacker fornì polvere da sparo e cannoni e poi tre dei suoi vascelli, con cui hanno bombardato gli insorti per una quindicina di giorni nella loro roccaforte, il castello di Hara. Lo stesso Coeckebacker comanderà uno di questi vascelli il De Ryp. Il 12 marzo 1638, Matsudaira gli chiese però di ritirarsi e lo ringraziò per il suo aiuto.I. Moris, The Nobility of Failure. Tragic Heroes in the History of Japan, p. 167 La partecipazione di Coeckebacker all'assedio su Shimabara, non era particolarmente gradita dai vari daimyō che facevano parte dell'esercito dello Shogun, inoltre anche gli olandesi non erano soddisfatti dai loro alleati che si stavano dimostrando disorganizzati e stavano attuato una strategia inefficace.I. Moris, The Nobility of Failure. Tragic Heroes in the History of Japan, p. 464
Nel 1640, tentò, senza successo, di negoziare un accordo commerciale con i signori di Trinh, dei governanti del Vietnam.John Kleinen, Leeuw en Draak: Vier Eeuwen Nederland en Vietnam, p. 39 Dopo il suo ritorno nei Paesi Bassi, Coeckebacker si sposò e divenne scabino nella sua città natale Delft.
Note
Voci correlate Compagnia olandese delle Indie orientali Rivolta di Shimabara