Il Jerusalem Challenger 1999 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 1999. Il torneo si è giocato a Gerusalemme in Israele dal 10 al 15 maggio 1999 su campi in cemento.
Vincitori Singolare
Lior Mor ha battuto in finale Neville Godwin con il punteggio di 7–5, 5–7, 6–2
Doppio
Jeff Coetzee / Tuomas Ketola hanno battuto in finale Barry Cowan / Neville Godwin con il punteggio di 6–2, 6–4
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