ハプログループR (mtDNA) はユーラシアを中心に広く分布するミトコンドリアDNAハプログループである。このグループは約70,000年前の出アフリカ後の移住に関連している。ハプログループNを親系統に持ち、B、F、R0、JTなどの子系統を生み出した。
起源と分布 Soares et al. (2009)はハプログループRの誕生を (95% CI)(およそ80,000 - 50,000年前、おそらく65,000年前)と推定した。
このグループの分布は、現生人類の東アフリカから西、南、東南アジアへの移住と一致する。 およそ70,000年から60,000年前の間に、ハプログループM、N、およびRの初期の下位系統が出現したと考えられる。特に南アジアの先住民で幅広い多様性と古さを示しており、インド西部と南部のトライブとカーストは他の地域よりも多様性が高く、おそらく彼らの自生の地位を示唆している。シベリアのウスト・イシム人はハプログループR*に属している。
ハプログループRとその子孫は、オーストラリア、南北アメリカ、東南アジア、南アジア、中央アジア、西アジア、東アジア、ヨーロッパ、北アフリカ、アフリカの角に分布しているが、パラグループR*は、ソコトラ(1.2%)、北東アフリカ(1.5%)、中東(0.8%)、近東(0.8%)、アラビア半島(0.3%)に見られるため、このあたりが発祥地と考えられる。
脚注