thumb|200px|right|都営港南四丁目第2アパート。港南支所はここの下層部に入居している thumb|200px|right|出入口の上を東京モノレール線の高架が通っている
都営バス港南支所（とえいバスこうなんししょ）は、東京都港区港南にある都営バスの営業所（支所）。品川営業所の支所であり、正式名称は東京都交通局品川自動車営業所港南支所。営業所記号はYを用いる。
海岸通り沿いに位置し、最寄りバス停留所は港南四丁目。都営港南四丁目第2アパートの下層部を使用している。ナンバープレートは品川である。
2008年から、はとバスへの管理委託が行われている。
概要 1990年代の末にお台場方面への路線拡大による車両の回送距離を減らし、台場地区の需要の変動に対応することを目的に、当時の目黒営業所（品川区上大崎三丁目の目黒駅東口に所在『都バス路線案内』1999年4月版、東京都交通局発行より。2000年12月以降は支所）の分駐所として開設され、目黒支所の分駐所化に伴い品川営業所の管轄（ただし目黒・港南は一体で、品川本局とは区別されていた）となったのち、2005年3月に目黒分駐所廃止に伴い（跡地は目黒セントラルスクエアとして再開発）、支所へと昇格した。同支所の記号は1982年3月29日に廃止された志村営業所（板橋区東坂下）で使用されていたYである。
主力路線は、浜松町駅からお台場地区へのアクセス路線である虹01や、東急バスとの共同運行で等々力操車所前→等々力駅前から目黒区 - 目黒駅前 - 東京タワーを経由し東京駅丸の内南口までを結ぶ東98系統などの所管があったが、これらは2013年4月1日に廃止され、現在は城南・高輪地区をメインに担当している。
港南支所には本格的な車両点検の施設がなく、日常の検査以外の修理・点検などは品川営業所で行っている。
また、都営バスの営業所支所でありながら、2005年3月まで定期券の窓口販売が行われていなかった。
沿革 thumb|200px|目黒営業所（2000年撮影） 品川近辺には古くからの品川営業所があったが、その後、目黒営業所の周辺が目黒駅再開発のエリアとなるため、。のちに当初の計画は消滅したが、冒頭の目的である台場方面の前線基地のほかに、計画が遅れていたが本家である目黒営業所が再開発の開始で閉鎖されたため、その代替施設としての位置付けもある。
用地は元々、東京都の宿舎として使用されていた場所であり、東海道新幹線の回送線や東海道貨物線が脇を通り、東京モノレール羽田空港線の線路の下にあるため、モノレール車内からも車庫構内が見える。当初は目黒営業所港南分駐所を名乗っていたが、2000年12月には目黒営業所の支所化で品川営業所目黒支所港南分駐所、さらに2003年に目黒支所が分駐所に組織変更されると品川営業所港南分駐所となっていた。2005年3月に品川営業所目黒分駐所廃止に伴い、支所へと昇格した。車両は旧:目黒営業所に所属していた車のうち、大型車は全車両港南支所で引き続き使用され、品川営業所とは東98・黒77系統用の車両との交換が行われた。しかし目黒分駐所が担当していた路線は、一部を除き品川営業所に所轄変更され、反対に埋立地の路線を中心に港南に移管した。
2000年11月に、都営バスの営業所で初めて低硫黄軽油（S-50相当）の導入が行われた。
2008年4月1日から、当支所の全路線がはとバスに管理委託された。
現行路線 都03・04系統（グリーンアローズ）
thumb|200px|right|2001年頃、深川所管時代の都03系統 都03：四谷駅 - 半蔵門 - 日比谷 - 数寄屋橋 - 銀座四丁目 - 勝どき駅 - 晴海五丁目ターミナル 都03：四谷駅 - 半蔵門 - 日比谷 - 有楽町駅前 - 東京駅丸の内北口（平日のみ） （東16→銀16→）都04：東京駅丸の内南口 - 有楽町駅前 - 銀座四丁目 - 勝どき駅 - 豊海水産埠頭 東京都乗合自動車の運行系統の名称及び区間、昭和54年11月22日 交通局告示第11号 都04出入：勝どき駅 - 新豊洲駅 - 有明小中学校前 - 有明一丁目
都03系統の沿革 1968年（昭和43年）2月25日：都電11系統（新宿駅前 - 月島間）の代替路線として、511系統（その後、銀71系統へ）が開業する東京都交通局70年史、p.52、2-11-(1)表 代替バス推移による。 1988年（昭和63年）3月21日：都市新バス化され、都03系統に改番される東京都交通局90年史、p.426。 2000年（平成12年）12月12日：都営大江戸線全線開業に伴う路線再編により、新宿駅西口 - 四谷駅前間を短縮。担当営業所を杉並営業所（この再編に伴い杉並支所に格下げ）から深川営業所に変更する「大江戸線等開業に伴う都営バス路線の再編整備の実施について」東京都交通局、平成12年11月30日。 2012年（平成24年）4月1日：都市新バスだが、はとバス委託路線となり、深川営業所から本支所に移管する。 2022年（令和4年）4月1日：四谷駅 - 東京駅丸の内北口間の運行開始都営バスのダイヤ改正について 東京都交通局、2022年3月17日、2022年4月9日閲覧。 2024年（令和6年）4月1日：晴海側の経路を変更し、晴海埠頭発着から晴海五丁目ターミナル（HARUMI FLAG）発着に変更都営バスからのお知らせ 東京都交通局、2024年3月1日、2024年3月3日閲覧。（ほかに晴海埠頭を発着する都05-1および錦13は経路変更を行うが晴海埠頭発着を維持）。
都04系統の沿革 2021年（令和3年）11月1日：江東営業所より一部の運用が有明営業所に移管。 2022年（令和4年）4月1日：江東営業所との共管を解消、有明営業所単独運行となる。急行便である直行02系統は引き続き江東営業所が担当。 2024年（令和6年）3月29日：この日の運行をもって急行便である江東営業所管轄の直行02が廃止となる都営バスからのお知らせ 東京都交通局（2024年3月1日）。 2026年（令和8年）4月1日：港南支所および臨海支所に移管。都04出入系統（勝どき駅 - 有明一丁目）を新設。
都03系統は都電第2次撤去で廃止された大久保電車営業所所管の都電11系統と、それに並行して清水操車所 - 晴海埠頭間を結んでいた、杉並支所の前身である堀ノ内自動車営業所所管の304系統が始まり。1970年（昭和45年）の都電第5次撤去に合わせた路線再編成で両路線は統合され、銀71系統となる。
都心を横断する路線の為、1988年（昭和63年）3月21日に都市新バスの第3期導入路線となったのを機に系統番号を都03に改め、都04・都05系統と共に「グリーンアローズ」と名付けられた。晴海通りの需要の他、新宿駅発着のJR・私鉄線から三宅坂にある国立劇場への足としても重宝され、最盛期には数寄屋橋・銀座 - 勝どき橋（晴海通り上）では停留所に行けば、昼間でも少し待つだけで3系統のどれかが来る程だった。
晴海見本市会場の機能がビッグサイトへ移転した後は、利用客の減少が進んだ。このため営業成績は悪化の一途を辿り、1990年代後半頃から晴海方面からの四ツ谷駅止まり便が増えていく。そして、2000年の都営大江戸線開通時の再編で、営団（現・東京メトロ）丸ノ内線と重複する新宿駅西口 - 四谷駅前を短縮のうえ杉並営業所から深川営業所に移管し、運行回数を半分以下まで削減した。
その後も乗客の減少に歯止めがかからず、度々のダイヤ改正で減便を余儀なくされており、現在では日中の一部時間帯で40分以上間隔が空く状態となってしまっている。2007年3月26日の改正では土曜・休日の本数がさらに減少し、1時間に1本となっている。
2012年（平成24年）4月1日付ではとバス委託路線となり、深川営業所から移管されてきた都営バスのダイヤ改正について 東京都交通局、2012年3月9日。はとバスに管理委託される都市新バス路線はこの都03系統が初となった。
2022年（令和4年）4月1日より、平日限定の区間便として四谷駅〜東京駅丸の内北口間の運行を開始した。この新設については都05系統など他の路線で晴海通り区間のバスが十分供給されていることから、四谷 - 東京駅間の需要開拓に向けた試みとしている。
反94系統 反94：五反田駅 - 高輪台駅 - 明治学院 - 魚籃坂下 - 古川橋 - 麻布十番駅 - 赤羽橋駅（平日のみ運行）
8の字循環だった反96系統のうち、高輪台駅方面を分割のうえ2002年（平成14年）12月1日に誕生、この際に魚籃坂下 - 赤羽橋駅間を反96系統時代の慶応義塾大経由から、もともと流動のあった三ノ橋・麻布十番駅経由に変更した。五反田駅前を出ると国道1号に入り高輪台駅前・明治学院前を経由、魚籃坂下交差点で桜田通りを離れて古川橋・一ノ橋を経由して赤羽橋駅に至る。麻布十番駅 - 赤羽橋駅は、都06系統の赤羽橋駅前発着便と同じく、古川を挟んで上下で別のルートとなっている。
魚籃坂下 - 麻布十番駅は反96系統本線と平行しており、高輪台駅 - 魚籃坂下が独自区間となっているが、2000年の南北線・都営三田線・都営大江戸線の相次ぐ各地下鉄延伸開業により、この区間では徐々に本数を減らし、現在は平日に朝3往復・夕4往復が残るのみである。これは、系統単独では山手線の内側で完結する路線バスの中で最少で、独自区間での乗降もあるが、五反田駅前 - 麻布地域での利用が多く定時性も良いため、事実上は反96系統の短絡ルートとなっている。
2025年4月1日のダイヤ改正より、土休日の設定が無くなった。
反96系統 反96：五反田駅 - 御殿山 - 品川駅高輪口 - 泉岳寺 - 魚籃坂下 - 麻布十番駅 - 六本木駅 - 六本木ヒルズ 反96：品川駅高輪口 - 泉岳寺 - 魚籃坂下 - 麻布十番駅 - 六本木駅 - 六本木ヒルズ 反96：五反田駅 - 御殿山
五反田駅から御殿山・品川駅・麻布十番駅を経て六本木ヒルズへ向かう。ソニーグループ御殿山テクノロジーセンターへの通勤輸送、および同センターと品川駅港南口にある本社（ソニーシティ）を結ぶ輸送を担う。
元々は品川営業所の所管であり、様々な系統の再編を通して出来上がった。旧・反96や東90といった系統の面影は全く見られず、大江戸線開業以降の再編は迷走を極める。2000年（平成12年）12月12日の大江戸線開業時には、四92系統の品川駅 - 赤羽橋駅間と廃止された田70系統のごく一部の区間、反90甲（旧・東90）系統の五反田駅 - 品川駅間を統合し、3代目の反96系統となった。
2006年（平成18年）4月1日より約20分毎に増便し、麻布十番駅から先は出入などを除き、「六本木循環」麻布十番駅を基点に、六本木けやき坂 → 六本木ヒルズ → 六本木駅 → 六本木五丁目と時計回りに循環する。なお、同じく六本木ヒルズを循環する都01折返・RH01系統は六本木ヒルズ → 六本木けやき坂と反時計回りに循環する。に変更した。
2013年4月1日の改編で六本木循環（五反田駅→麻布十番駅→六本木ヒルズ→六本木駅→六本木五丁目→麻布十番駅→五反田駅）が六本木五丁目・六本木駅経由の六本木ヒルズ往復系統に変更、六本木けやき坂を経由しなくなった。また、反96折返・赤羽橋駅前発着系統も廃止された。
2026年4月1日より港南支所の所管となった。この移管に伴い、入出庫として設定されていた品川車庫 - 六本木ヒルズの設定が取り止められた。
井96系統 井96 大井町駅東口 - 青物横丁 -（←南馬場／都立八潮高校→）- 天王洲アイル（パークスクエア）（循環）
大井町駅前を出発後、青物横丁を基点に反時計回りで天王洲地区を経由し、再び大井町駅前へ至るラケット型の循環路線。1992年に品91折返系統として、大井町駅前と天王洲地区のアクセス向上を目的に開通したが、当初は平日のみの運行だった。その後、大井町駅に関係する系統の再編により、井96系統として独立、さらに2002年の品91・品98系統再編に伴う補強として、大井町駅前方面行きの南馬場経由化、土休日の運転開始・ダイヤ増発が行われ、段階的に規模を大きくしてきた路線。2005年の港南分駐所格上げに伴い、品川営業所より移管された。
ダイヤは品川営業所時代に上記の経緯で拡充され、2002年のりんかい線全通時にはほぼ影響を受けなかったものの、港南支所移管時に大幅減便され、特に土休日は終日毎時1-2本まで減回されている。
品97系統 品97（平日・土曜）：品川駅高輪口 - （← グランドプリンスホテル新高輪/泉岳寺 →）- 天現寺橋 - 西麻布 - 青山一丁目駅 - 信濃町駅 - 四谷三丁目 - 新宿追分 - 新宿駅西口 品97（日曜・祝日）：品川駅高輪口 - （← グランドプリンスホテル新高輪/泉岳寺 →）- 天現寺橋 - 青山一丁目駅 - 信濃町駅 - 四谷三丁目 - 歌舞伎町 - 新宿駅西口
2008年4月1日より、杉並支所との共管となる。はとバス委託路線として、初の共管路線となっている。
井98系統 （品98丁→）井98甲：大井町駅東口 - 青物横丁 - 大井清掃工場 -（→ダイトー大井物流センター）- 大井水産物埠頭 （品98戊→）井98乙：大井町駅東口 - 青物横丁 - 大井清掃工場 -（←ダイトー大井物流センター）- 大井水産物埠頭
1994年（平成6年）7月に品98系統から独立した路線で、当初は品98丁・戊を名乗った。大井町駅東口から青物横丁駅付近を経由し、大井埠頭地区とをダイレクトに結ぶ。品98系統とともに大田区を通る数少ない都営バス路線でもある。いずれも休日運休、昼前後の運行はされていない。終点付近は大井水産物埠頭入口を基点に、午前はダイトー大井物流センター先回り、午後はその逆のループ状の経路をとるが、循環扱いを行っておらず一旦大井水産物埠頭で運行は打ち切られる。
当初は行先とともに「直通」の文字を掲げていた。これは経路上、旧・品98甲系統（大井町駅東口 - 大井埠頭中央公園 - 大井埠頭 - 品川駅東口）をショートカットする意味で、急行運転は行われていない。
田99系統 田99：品川駅港南口 - 五色橋 - 芝浦埠頭 - 田町駅東口 田99出入：港南四丁目（港南車庫）- （直行）- 品川駅港南口
1967年（昭和42年）10月に品川営業所の管轄で開通した路線である。開業から長らく朝夕のみの運行、港区スポーツセンター発着だったが、2002年（平成14年）の新・虹02系統廃止により日中の運行を開始、2004年（平成16年）4月には田町駅東口交通広場の完成に伴い田町駅東口発着となった。その後は平日と土曜が再び朝夕のみの運行となり、休日のみ日中にも運行されている。この路線は品川→港南→品川と移管され、2005年（平成17年）3月28日付で港南支所に移管、その後はとバス委託となる。
出入系統は品99・田99系統の港南分駐所への移管と同時に品99出入系統として開設されたものだったが、現在は田99系統に編入されている。以前より大幅に減便されている為、現在は平日3回、土休日2回設定されている。
廃止・移管系統 港南時代に廃止・移管された系統 速01系統（快速バス） 速01：東京駅八重洲口 - 銀座四丁目 -（レインボーブリッジ）- お台場海浜公園駅 - 船の科学館駅 - パレットタウン（循環）
レインボーブリッジ経由で東京駅八重洲口と臨海副都心を結んでいた。当初は都市新バス（都03・05系統）の経年車（日野・ブルーリボン、S201-203・205-207号車）を使用して東京駅八重洲口 - ホテル日航東京（現・ヒルトン東京お台場）・東京ビッグサイト間を運行していたが、1998年（平成10年）夏には貸切車（ガイドが乗務、車両は各営業所から寄せ集め）を使用、2000年（平成12年）からは貸切車（いすゞ・スーパークルーザー、X001 - 003・005-007号車）を転用し、経路も東京駅丸の内南口発着、有楽町駅・銀座四丁目経由に変更され、専用車はアクアシティお台場・デックス東京ビーチ・ヴィーナスフォートいずれかのラッピング装飾が施された。
座席定員制で、運賃は大人300円・小児150円、2000年（平成12年）からは誕生日に乗ると身分証明書の提示で運賃が無料になる特典が設けられた銀座とお台場をセットにしました 4月1日、臨海副都心への快速バスが生まれ変わります 東京都交通局トピックス（アーカイブ）。。その後、車両の老朽化等を理由に2003年（平成15年）3月31日をもって廃止となった。
虹01系統 thumb|200px|right|かつて虹01には専用のイラストが付いた車両が充当されることがあった(A-A464、既廃車)
thumb|200px|right|2013年4月1日からは同一経路でkmフラワーバスの運行が開始された 虹01：浜松町駅バスターミナル - 浜松町駅前 - 竹芝桟橋 -（レインボーブリッジ）- お台場海浜公園駅 - フジテレビ前 - 船の科学館駅 - テレコムセンター駅 虹01：浜松町駅バスターミナル - 浜松町駅前 - 竹芝桟橋 -（レインボーブリッジ）- お台場海浜公園駅 - フジテレビ - 船の科学館駅 - テレコムセンター駅 - 東京ビッグサイト 虹01：浜松町駅バスターミナル - 浜松町駅前 - 竹芝桟橋 -（レインボーブリッジ）- お台場海浜公園駅 - フジテレビ前 - 船の科学館駅 - テレコムセンター駅 - 国際展示場駅 虹01：浜松町駅バスターミナル - 浜松町駅前 - 海岸通り - 港南車庫（港南四丁目）
浜松町駅と東京ビッグサイト・国際展示場駅前をレインボーブリッジ経由で結ぶ。東京ビッグサイトでのイベント開催時に運行される国展03系統（浜松町駅 - 東京ビッグサイト）も本系統の臨時増発便と位置付けられるが、港南以外は運用に入らず、ピーク時に品川営業所の応援がある程度であった。
当初は田町駅東口からレインボーブリッジまでの路線として開通したもので、経路上は現路線と関連は薄く、系統番号以外は全くの別路線である。レインボーブリッジ展望台利用客向けの観光路線だったが、次第に通勤路線の色合いが強くなるとともに平日の運行回数も増え、経路もレインボーブリッジへの直通からダイヤモンドパレス・ピアシティ芝浦などを経由するようになると同時に、田町駅東口側も港区スポーツセンター前発に変更した。しかし、お台場地区の目覚しい発展から路線を新設することとなり、系統番号を譲ることになる。そして、1997年2月3日から誕生した新・虹01系統は、浜松町駅前からレインボーブリッジを渡り、フジテレビなどがあるお台場へのアクセス手段として機能していた。
当初は品川営業所との共同運行だったが、1年で共管先が深川営業所に変更された。その後、りんかい線が延伸開業すると、需要が減って改正のたびに減回され、全便がテレコムセンター経由となった結果、当初は毎時5回程度だったものが、末期は日中に毎時1回となる時間帯もあった。
開通から現在まで浜松町駅 - 国際展示場駅が本線だが、多くが東京ビッグサイト行きとなっている。一部はテレコムセンター駅前止まりの他に港南車庫への出入便として港南四丁目発着（海岸通り経由）が運転される。出入便のうち浜松町駅前行は毎日早朝4本のみ、港南四丁目行きは平日の夜3本のみ運転。
1998年（平成10年）5月1日からPTPSを導入しており、信号の優先制御を経路上で実施している。これに対応した機器を搭載する必要があるため、PTPS装着車は一般車と区別するために前面にお台場を象徴するレインボーブリッジなどのイラストを貼り付けており、PTPSは目黒通りにも導入されたため、分駐所時代よりPTPS搭載車であれば虹バスか否かに関係なく運用される。
レインボーブリッジが強風、催事などで通行止めになると、この路線は浜離宮 - 勝どき - 晴海 - 豊洲 - 有明経由となる。。レインボーブリッジ上層部の首都高台場線が通行止めになっても下の一般道は通行可能な場合が多い。
2013年（平成25年）4月1日の改編で廃止され、ケイエム観光バスが運行するkmフラワーバスに引き継がれたが､2017年5月31日を以って同社でも路線廃止となり､完全撤退した形となった｡都営バスの路線変更等について 東京都交通局、2013年3月1日。乗客は比較的多かったものの、ほとんどが固定客で、途中乗降が少なく運賃収入が増えないことから赤字であったことに加え、港区がお台場レインボーバスの運行を開始したことで追い討ちを掛けられた都バス、唯一のレインボーブリッジ路線を4月廃止 日本経済新聞電子版、2013年2月26日。なお、出入庫路線の港南四丁目発着便（橋86系統に編入）のうち浜松町駅行きのみ、改変後も平日早朝2本に限り運行（バスターミナルには入らない。路上の浜松町駅前で終点）、浜松町駅前からは回送のうえそれぞれ都03・橋86系統となる。
その後、レインボーブリッジを渡る都営バスは品川営業所の波01出入系統があったが、こちらも2022年（令和4年）3月31日をもって運行を終了し、レインボーブリッジを経由する都営バスの路線は全廃となった 都営バスの路線変更等について 東京都交通局、2022年10月25日閲覧。
波01系統 波01：東京テレポート駅 - 日本科学未来館前 - テレコムセンター駅 - 環境局中防合同庁舎 - 中央防波堤
2006年（平成18年）4月に運行開始。当初は港南支所と深川営業所の共管だったが、港南支所のはとバス委託に伴い港南担当分を品川営業所に移管。
反90系統 （反90乙→）反90：五反田駅 - 高輪台駅 - 高輪一丁目 - 田町駅
1950年（昭和25年）5月15日に122系統として、久が原 - 五反田駅 - 田町駅 - 東京駅八重洲口を東急バス神明営業所（現・荏原営業所）との相互乗り入れで開通した路線である（1951年（昭和26年）5月に多摩川大橋まで延長）。都営地下鉄1号線の全線開業で完全並行となり、1970年（昭和45年）9月20日限りで多摩川大橋 - 五反田駅間を廃止のうえ東急との相互乗り入れも終了。1972年（昭和47年）11月以降は東96系統を名乗ることとなる。担当は品川営業所だった。
この東96系統も第3次再建計画に伴う路線再編成により、1982年（昭和57年）12月26日付で初代・反96系統（五反田駅 - 田町駅 - 一ノ橋 - 清正公前 - 五反田駅）に変更のうえ目黒営業所に移管。それも1990年（平成2年）7月1日付けで分割され、2代目反96系統（五反田駅 - 一ノ橋 - 赤坂アークヒルズ - 新橋駅。目黒営業所担当）と反90乙系統（五反田駅 - 高輪三丁目 - 田町駅 - 三田駅。品川営業所担当）となり、後者は2000年（平成12年）12月12日に反90甲系統が3代目反96系統に統合されることに伴い反90系統となり、その後はとバス委託で港南支所に移管された。高輪台駅から田町駅にかけては比較的狭隘な道路を走行するため、普段は中型車や中型ロング車で運行されていた。
2012年（平成24年）のちぃばす高輪ルート本格運行開始に伴い本数が大きく減少。朝夕各4本ずつの計8本のみの運行となった後、2015年（平成27年）3月31日限りで廃止となった。東急側は反01系統（五反田駅 - 川崎駅西口北）として存続している。
田92系統 田92：田町駅東口 ← 藻塩橋 ← 高浜橋 ← 品川駅港南口 ← 天王洲橋 ← 品川車庫 (出庫) 2022年（令和4年）3月をもって品川車庫始発便が廃止、全便が品川駅港南口～田町駅東口間の運行となった。
品93系統 品93甲：目黒駅 - 明治学院 - 品川駅 - 品川車庫 - 都立高専 - 東京陸運支局（鮫洲試験場） - 大井競馬場 品93甲：目黒駅 → 明治学院 → 品川駅 → 品川車庫 → 都立高専 品93乙：目黒駅 - 明治学院 - 品川駅 - 北品川 - 都立高専 - 東京陸運支局（鮫洲試験場） - 大井競馬場（第一京浜経由・平日朝運行）
2005年（平成17年）3月の港南支所への昇格と同時に参入、共管となっていた。その後、2008年（平成20年）4月の港南のはとバス委託化に伴い品川営業所単独に戻された。
品98・品99系統 品98甲：品川駅東口 - 天王洲橋 - 品川清掃工場 - セントラルビル - 大田市場 品98乙：品川駅東口 → 天王洲橋 → 品川清掃工場 → セントラルビル → 大井埠頭バンプール（朝運行） 品98丙：品川駅東口 -（急行）- 大田市場（平日・土曜早朝1本のみ、市場定休日は運休） 品99：品川駅東口 → 港南四丁目 → 東京出入国在留管理局 → 京浜運河 → 品川埠頭 → 品川駅東口（循環） 品99折返：品川駅東口 - 港南四丁目 - 東京出入国在留管理局（平日のみ）
港南支所のはとバス委託化に伴い、品川営業所に再移管。
東98系統
東98：東京駅丸の内南口 - 経済産業省前 - 東京タワー - 赤羽橋駅 - 魚籃坂下 - 目黒駅 - 清水 - 都立大学駅北口 - 等々力七丁目 - 等々力駅 ← 等々力操車所（東京急行電鉄→東急バス目黒営業所と共同運行） 東98：東京駅丸の内南口 → 経済産業省前 → 東京タワー → 赤羽橋駅 → 魚籃坂下 → 目黒駅 東98：目黒駅 - 清水 - 都立大学駅北口 - 等々力七丁目 - 等々力駅 ← 等々力操車所（出入庫）
1948年（昭和23年）11月に東京駅丸の内南口 - 自由が丘（現・八雲三丁目）間の113系統として営業を開始した路線で、当初の都営は渋谷営業所が担当だったが、目黒営業所の復旧により移管された。東京駅丸の内南口を起点に、日比谷、赤羽橋駅前、白金台駅前、目黒駅前、都立大学駅北口経由で等々力駅前に至る。東急バスとの共同運行で長距離路線であったことから、警視庁と共同で行っているPTPSの導入路線となっている。地下鉄網が現在よりも恵まれなかった頃は、この路線以外にも都心・郊外直通型の相互乗り入れ路線が数多く存在したが、交通事情により大部分が分割・短縮され、1984年（昭和59年）2月16日以降は都営と東急が共同運行を行う唯一の路線となっただけではなく、大手民営バスが都心部まで乗り入れる光景が見られる唯一の路線ともなっていた。
東急バスは途中の清水停留所にある目黒営業所が運行を担当。目黒駅以南では目黒通りを通る多数の東急バス路線（東98系統のほか、黒01、黒02、黒06、黒07系統など）があり、運行本数も東急バスの方が圧倒的に多いが、都営バスの運賃は目黒駅以南でも運行終了当時200円と東急バスより10円安くなっていた（目黒駅以南で東急バスを利用する場合は、東98系統利用の場合を含め運賃が当時210円であった。なお東急バスの東98系統の運賃についてはこちらを参照）。
なお、共同運行上の特徴として、 都営バスの等々力方向行きは等々力駅前（東急の等々力停留所）で営業を終了し等々力操車所に回送。折返しは等々力操車所から乗車扱いを行っていた。東急は往復とも等々力操車所前停留所発着で営業。 等々力方向の行先表示は都営が「等々力」、東急は「等々力操車所」、東京駅方向の行先表示は都営が「東京駅丸の内南口」2000年12月の改編以前は都営も「東京駅南口」と表示されていた。、東急は「東京駅南口」、目黒駅前行きは都営、東急とも「目黒駅」となっていた。
中型車幅10.5ｍノンステップ車の日野・レインボーHRが主に使用されるが、一般の大型ノンステップ車（日野・ブルーリボンⅡ等）や日野・ブルーリボンシティハイブリッドなどが使用されることもあった。