ヤン・M・ルイター（Jan M. Ruijter）は、オランダで活動する分子生物学者。アムステルダム大学医学センター（Amsterdam UMC）の医学・生物学部門に所属し、リアルタイムPCR（qPCR）の増幅曲線解析、PCR効率を考慮した定量法、および解析ソフトウェアLinRegPCRの開発に関する研究を行っている。
経歴 ルイターは、アムステルダム大学のAcademic Medical Center（現在のAmsterdam UMC）で解剖学、発生学、生理学などの研究に携わり、同センターの研究者プロフィールではMedical BiologyのAssistant Professorとして掲載されている。同プロフィールによれば、退職後はPCR効率を補正した定量PCRデータ解析に重点を置き、LinRegPCRおよびfactor_qPCRなどの解析プログラムを開発・公開している。
2003年、Christian Ramakers、Ronald H. Lekanne Deprez、Antoon F. M. Moormanとともに、定量リアルタイムPCRの増幅曲線について、各試料の蛍光データの対数値をサイクル数に対して線形回帰することにより、PCR効率と初期標的量を推定する解析法を報告した。この研究では、従来の標準曲線や一定のPCR効率を仮定する方法に依存しない解析法としてLinRegPCRが提示された。
その後も、PCR効率の推定、増幅曲線解析、ベースライン補正など、qPCRデータ解析に関する方法論の研究を続けた。
研究業績 ルイターは、リアルタイムPCRにおける増幅曲線からPCR効率と初期標的量を推定する方法の研究を行っている。
2009年には、ベースラインの推定誤差がPCR効率の推定値に直接影響し、その誤差が初期標的量や発現量の比の計算に増幅されることを示した。また、増幅曲線の指数増幅相を利用してベースラインを補正し、PCR効率を推定する解析法を報告した。
2013年には、複数のqPCR増幅曲線解析法について、バイアス、分解能、精度などの観点から比較評価を行った。この研究にはヤン・ヘレマンスおよびヨハン・ファンデソンペレも共著者として参加している。
2019年には、カール・ウィットワーらとともに、SYBR Greenを用いたqPCRで目的産物以外の増幅産物が生じた場合に、融解曲線解析を利用してその影響を補正する方法を報告した。
2021年には、Cq値のみを用いた定量ではPCR効率の違いによって結果に偏りが生じうるとして、実際の増幅効率を考慮した解析の必要性を論じた。同年には、従来のWindows版LinRegPCRを基に、増幅曲線と融解曲線を解析できるWeb版LinRegPCRも報告された。
2025年には、スティーブン・A・バスティン、ミカエル・クビスタ、マイケル・W・プファール、ヨハン・ファンデソンペレ、カール・ウィットワーらとともに、定量リアルタイムPCR実験の設計、解析、報告に関するMIQEガイドラインの改訂版「MIQE 2.0」の共著者となった。
同年、Maurice J. B. van den Hoffとの総説では、PCR効率の推定から効率補正を行った標的量の算出、さらに既知濃度の標準を用いた絶対定量までのqPCRデータ解析法を整理した。
主な論文 Ramakers C, Ruijter JM, Lekanne Deprez RH, Moorman AFM. Assumption-free analysis of quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) data. Neuroscience Letters. 2003;339(1):62–66. Ruijter JM, Ramakers C, Hoogaars WMH, Karlen Y, Bakker O, van den Hoff MJB, Moorman AFM. Amplification efficiency: linking baseline and bias in the analysis of quantitative PCR data. Nucleic Acids Research. 2009;37(6):e45. Ruijter JM, Pfaffl MW, Zhao S, Spiess AN, Boggy G, Blom J, Rutledge RG, Sisti D, Lievens A, De Preter K, Derveaux S, Hellemans J, Vandesompele J. Evaluation of qPCR curve analysis methods for reliable biomarker discovery: Bias, resolution, precision, and implications. Methods. 2013;59(1):32–46. Ruijter JM, Barnewall RJ, Marsh IB, et al. Efficiency Correction Is Required for Accurate Quantitative PCR Analysis and Reporting. Clinical Chemistry. 2021;67(6):829–842. Untergasser A, Ruijter JM, Benes V, van den Hoff MJB. Web-based LinRegPCR: application for the visualization and analysis of (RT)-qPCR amplification and melting data. BMC Bioinformatics. 2021;22:398. Bustin SA, Ruijter JM, van den Hoff MJB, et al. MIQE 2.0: Revision of the Minimum Information for Publication of Quantitative Real-Time PCR Experiments Guidelines. Clinical Chemistry. 2025;71(6):634–651.
関連項目 リアルタイムPCR PCR効率 融解曲線解析 MIQEガイドライン 絶対定量 スティーブン・A・バスティン カール・ウィットワー
脚注